More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0556 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0556  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
162 aa  330  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  56.13 
 
 
317 aa  191  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0740  peptide methionine sulfoxide reductase  55.56 
 
 
162 aa  187  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.800973  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  53.75 
 
 
337 aa  186  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0722  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  57.58 
 
 
309 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.957852  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  52.87 
 
 
346 aa  179  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  52.32 
 
 
348 aa  179  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  53.64 
 
 
332 aa  174  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  50.98 
 
 
316 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0286  methionine sulfoxide reductase A  50.3 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  54.25 
 
 
359 aa  168  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  52.26 
 
 
170 aa  168  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  56.05 
 
 
157 aa  167  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  52.29 
 
 
375 aa  167  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1502  peptide methionine sulfoxide reductase  52.26 
 
 
166 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.859689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  55.56 
 
 
157 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl050  methionine sulfoxide reductase A  50.96 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.64 
 
 
590 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  47.53 
 
 
611 aa  160  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  48.39 
 
 
405 aa  160  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  53.25 
 
 
309 aa  160  7e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  49.68 
 
 
368 aa  158  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  47.71 
 
 
385 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  45.1 
 
 
735 aa  152  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  48.12 
 
 
177 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  50.98 
 
 
364 aa  150  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.35 
 
 
352 aa  144  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  44.52 
 
 
338 aa  142  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06586  methionine sulfoxide reductase A  43.87 
 
 
160 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000703  methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 
157 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf807  peptide methionine sulfoxide reductase A  43.71 
 
 
156 aa  136  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2638  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00490815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  42.48 
 
 
191 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  41.29 
 
 
178 aa  130  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 
183 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3135  methionine sulfoxide reductase A  43.75 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.457152  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2272  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0665  methionine sulfoxide reductase A  44.38 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.215107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  41.67 
 
 
177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 
176 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  42.68 
 
 
180 aa  127  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  42.58 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2741  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 
158 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2684  methionine sulfoxide reductase A  40.65 
 
 
158 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 
181 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0766611  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1839  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 
181 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1135  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 
179 aa  123  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0592  hypothetical protein  41.94 
 
 
329 aa  123  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000314472  hitchhiker  0.000621287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3045  peptide methionine sulfoxide reductase  39.1 
 
 
186 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735862  normal  0.359715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  38.61 
 
 
182 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0830  methionine sulfoxide reductase A  38.16 
 
 
178 aa  121  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0328757  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0740  methionine sulfoxide reductase A  42.5 
 
 
165 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0698569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  37.8 
 
 
182 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.46 
 
 
311 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1362  methionine sulfoxide reductase A  41.25 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.526795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.77 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  38.06 
 
 
179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  38.89 
 
 
197 aa  117  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  38.71 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  38.79 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  37.74 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0786  methionine sulfoxide reductase A  39.86 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  39.87 
 
 
162 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  38.56 
 
 
159 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  38.36 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1172  peptide methionine sulfoxide reductase  39.86 
 
 
175 aa  114  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0382873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  37.82 
 
 
181 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  36.42 
 
 
180 aa  114  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3550  peptide methionine sulfoxide reductase  36.67 
 
 
245 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1497  peptide methionine sulfoxide reductase  41.61 
 
 
191 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1099  peptide methionine sulfoxide reductase  38.41 
 
 
220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.545732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  39.1 
 
 
212 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  38.82 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  37.42 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0327  peptide methionine sulfoxide reductase  36.81 
 
 
446 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.445672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  35.48 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  36.13 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3429  peptide methionine sulfoxide reductase  38.71 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  0.0264207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4424  peptide methionine sulfoxide reductase  38.61 
 
 
223 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00185603  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00778  methionine sulfoxide reductase A  42.95 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  38.06 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0432  peptide methionine sulfoxide reductase MSRA  40.26 
 
 
216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.025885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  37.74 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  37.09 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  37.74 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.697588  normal  0.995502 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  38.16 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2619  peptide methionine sulfoxide reductase  37.74 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.79029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  38.27 
 
 
168 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  36.71 
 
 
170 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1855  peptide methionine sulfoxide reductase  41.18 
 
 
219 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.600225  hitchhiker  0.000343037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  38.16 
 
 
212 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  36.48 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  36.48 
 
 
186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  36.71 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  37.74 
 
 
186 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  38.85 
 
 
322 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  40.4 
 
 
186 aa  110  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>