More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0125 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 		 147 aa  307  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  77.24 
 
 		 147 aa  240  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5573  methionine sulfoxide reductase B  74.66 
 
 		 147 aa  235  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139871  normal  0.0985113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2966  methionine sulfoxide reductase B  73.79 
 
 		 148 aa  235  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3364  methionine sulfoxide reductase B  76.03 
 
 		 148 aa  233  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2143  methionine sulfoxide reductase B  73.79 
 
 		 149 aa  231  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113002  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2441  methionine sulfoxide reductase B  73.1 
 
 		 148 aa  230  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.660981 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0390  methionine sulfoxide reductase B  74.48 
 
 		 146 aa  228  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.504869  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0446  methionine sulfoxide reductase B  74.48 
 
 		 146 aa  228  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.342631  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2803  methionine sulfoxide reductase B  71.72 
 
 		 149 aa  226  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3070  methionine sulfoxide reductase B  65.97 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.364574  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4326  methionine sulfoxide reductase B  67.59 
 
 		 148 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5179  methionine-R-sulfoxide reductase  69.78 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5091  protein-methionine-S-oxide reductase  69.78 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5708  methionine-R-sulfoxide reductase  67.83 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5470  methionine-R-sulfoxide reductase  67.63 
 
 		 153 aa  202  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1106  methionine-R-sulfoxide reductase  67.86 
 
 		 157 aa  200  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7199  methionine-R-sulfoxide reductase  65.73 
 
 		 150 aa  197  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.929536  normal  0.310731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3736  protein-methionine-S-oxide reductase  63.97 
 
 		 151 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4211  methionine-R-sulfoxide reductase  59.15 
 
 		 158 aa  177  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1003  methionine sulfoxide reductase B  61.59 
 
 		 186 aa  173  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2286  methionine-R-sulfoxide reductase  61.15 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0188  methionine-R-sulfoxide reductase  59.12 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2072  methionine sulfoxide reductase B  58.5 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1045  methionine-R-sulfoxide reductase  57.78 
 
 		 364 aa  170  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  60.9 
 
 		 735 aa  169  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2264  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 		 351 aa  167  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  62.31 
 
 		 321 aa  167  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.08 
 
 		 321 aa  167  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.85 
 
 		 321 aa  167  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 321 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.08 
 
 		 321 aa  167  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.08 
 
 		 321 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.08 
 
 		 321 aa  167  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  63.08 
 
 		 321 aa  167  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 321 aa  167  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1234  methionine-R-sulfoxide reductase  60.58 
 
 		 290 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0160878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 321 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  56.64 
 
 		 311 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1630  methionine-R-sulfoxide reductase  60.45 
 
 		 323 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00819616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05500  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  58.21 
 
 		 385 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2088  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.78 
 
 		 352 aa  163  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1314  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  56.52 
 
 		 316 aa  163  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.147945  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  59.42 
 
 		 359 aa  162  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0906  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 		 375 aa  162  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2646  methionine-R-sulfoxide reductase  57.86 
 
 		 320 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00677049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1104  methionine sulfoxide reductase B  58.09 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1104  methionine sulfoxide reductase B  58.09 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 		 368 aa  159  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1374  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  57.58 
 
 		 590 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3952  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0102  peptide methionine sulfoxide reductase  59.26 
 
 		 381 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3054  methionine-R-sulfoxide reductase  58.21 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000457549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1279  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  55.8 
 
 		 337 aa  157  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000793  peptide methionine sulfoxide reductase  58.52 
 
 		 380 aa  157  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  56.52 
 
 		 158 aa  156  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.072868 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1839  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  54.68 
 
 		 348 aa  156  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.94451  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1860  methionine sulfoxide reductase B  57.36 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1009  methionine-R-sulfoxide reductase  55.22 
 
 		 397 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1633  peptide methionine sulfoxide reductase family protein  52.82 
 
 		 346 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00891353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1577  methionine sulfoxide reductase B  56.59 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0195  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000568952  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1085  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  55.15 
 
 		 332 aa  154  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1519  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  53.74 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1127  methionine sulfoxide reductase B  56.39 
 
 		 151 aa  153  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0557  peptide methionine sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 394 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.921771  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  54.14 
 
 		 611 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1503  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000972578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1541  methionine-R-sulfoxide reductase  54.79 
 
 		 353 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000985069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1554  peptide methionine sulfoxide reductase domain-containing protein  54.14 
 
 		 141 aa  151  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2611  peptide methionine sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 368 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2376  methionine sulfoxide reductase B  57.04 
 
 		 187 aa  150  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06690  peptide methionine sulfoxide reductase  55.97 
 
 		 380 aa  150  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0985  protein-methionine-S-oxide reductase  54.07 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000265676  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  59.84 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1043  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  49.32 
 
 		 416 aa  148  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.734062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0373  methionine-R-sulfoxide reductase  57.25 
 
 		 328 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  51.45 
 
 		 202 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.48 
 
 		 322 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0217  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.627751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0709  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  53.38 
 
 		 317 aa  145  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00161368  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1427  peptide methionine sulfoxide reductase  49.32 
 
 		 416 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.208524  normal  0.512662 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0999  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.680503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0704  methionine sulfoxide reductase B  53.24 
 
 		 191 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1893  methionine-R-sulfoxide reductase  53.73 
 
 		 405 aa  142  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00784315  unclonable  2.29788e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3626  methionine-R-sulfoxide reductase  55.88 
 
 		 212 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1363  peptide methionine sulfoxide reductase-like protein  53.52 
 
 		 338 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.312066  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0249  methionine-R-sulfoxide reductase  48.15 
 
 		 309 aa  141  4e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0910  methionine sulfoxide reductase B  57.72 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  53.79 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  53.91 
 
 		 156 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  55.12 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1483  methionine sulfoxide reductase B  47.06 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>