More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3456 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  83.13 
 
 		 168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  82.42 
 
 		 182 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  81.33 
 
 		 168 aa  297  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  81.71 
 
 		 172 aa  296  8e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  79.52 
 
 		 168 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  81.21 
 
 		 168 aa  296  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  78.31 
 
 		 168 aa  294  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  78.44 
 
 		 179 aa  291  4e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  77.11 
 
 		 169 aa  288  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  81.1 
 
 		 172 aa  289  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  78.05 
 
 		 168 aa  287  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  76.51 
 
 		 168 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 179 aa  284  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 169 aa  283  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 169 aa  283  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 169 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  77.58 
 
 		 169 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 		 171 aa  281  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  78.66 
 
 		 170 aa  280  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  75.76 
 
 		 172 aa  280  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  77.91 
 
 		 171 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  77.91 
 
 		 171 aa  280  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  76.36 
 
 		 169 aa  279  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  75.46 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  77.3 
 
 		 171 aa  278  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  77.44 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  75 
 
 		 179 aa  276  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  80.12 
 
 		 177 aa  275  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  73.94 
 
 		 179 aa  270  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  75.78 
 
 		 171 aa  267  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  72.22 
 
 		 166 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  69.51 
 
 		 167 aa  254  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  69.38 
 
 		 162 aa  248  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  70 
 
 		 166 aa  247  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  66.27 
 
 		 167 aa  246  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  69.75 
 
 		 166 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  67.08 
 
 		 168 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  66.46 
 
 		 311 aa  229  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  54.72 
 
 		 322 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3735  peptide methionine sulfoxide reductase  47.73 
 
 		 229 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  48.15 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.78 
 
 		 351 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  49.67 
 
 		 186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  43.9 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  47.53 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  46.11 
 
 		 213 aa  153  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.53 
 
 		 287 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1459  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.91 
 
 		 333 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.749481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  45.78 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.63 
 
 		 338 aa  151  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  48.73 
 
 		 209 aa  151  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.207853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  49.66 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.4 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  48.47 
 
 		 284 aa  148  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  44.05 
 
 		 242 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  46.15 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1371  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.84 
 
 		 334 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.896786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  48.7 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  46.91 
 
 		 290 aa  145  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 		 155 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.98 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  46.79 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  49.01 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3417  methionine sulfoxide reductase A  47.59 
 
 		 212 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  47.92 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.51 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  46.54 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1517  methionine sulfoxide reductase A  46.15 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  44.23 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  45.33 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0787  methionine sulfoxide reductase A  46.71 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0974  peptide methionine sulfoxide reductase  44.38 
 
 		 214 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  45.1 
 
 		 208 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  43.56 
 
 		 334 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  41.77 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  43.31 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 		 181 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  42.42 
 
 		 225 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0163  peptide methionine sulfoxide reductase  45.34 
 
 		 238 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  42.68 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2598  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1458  methionine sulfoxide reductase A  45.86 
 
 		 236 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1749  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3576  methionine sulfoxide reductase A  46.39 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0712  methionine sulfoxide reductase A  43.95 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3834  methionine sulfoxide reductase A  46.71 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.499173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  41.67 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  42.04 
 
 		 228 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00810  methionine-S-sulfoxide reductase  46.1 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 		 180 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  43.87 
 
 		 228 aa  134  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  45.52 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1129  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2632  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 225 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.712033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0458  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 		 213 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.494064  normal  0.107484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0714  methionine sulfoxide reductase A  42.77 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0260056  normal  0.0517203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>