More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
153 aa  315  1e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  69.42 
 
 
171 aa  175  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  58.45 
 
 
148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
146 aa  170  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
178 aa  170  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 
161 aa  168  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  56.03 
 
 
144 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  59.54 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  59.84 
 
 
133 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  60.16 
 
 
136 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
136 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  60.16 
 
 
136 aa  159  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  58.59 
 
 
133 aa  157  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  57.04 
 
 
149 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
133 aa  156  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
136 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
141 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 
136 aa  154  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  58.27 
 
 
147 aa  153  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  60.31 
 
 
141 aa  153  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 
131 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  60.66 
 
 
142 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  56.59 
 
 
133 aa  151  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 
133 aa  149  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 
135 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  56 
 
 
136 aa  148  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  53.03 
 
 
133 aa  148  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  56.15 
 
 
140 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  52.86 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  55.2 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  55.47 
 
 
136 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  55.2 
 
 
136 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  51.16 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  49.61 
 
 
134 aa  128  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  51.91 
 
 
133 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
133 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  49.26 
 
 
140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  51.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  55.28 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  51.22 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 
128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  48.51 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  52 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  49.26 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  51.2 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  50.78 
 
 
137 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  50.4 
 
 
136 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  48.41 
 
 
184 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  47.33 
 
 
134 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  52.38 
 
 
166 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  45.83 
 
 
142 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  47.97 
 
 
131 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 
137 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  50.4 
 
 
135 aa  122  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
131 aa  123  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
141 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  50.75 
 
 
136 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  47.18 
 
 
137 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
137 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.17 
 
 
159 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  50.81 
 
 
127 aa  121  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
140 aa  121  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.2 
 
 
147 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  48.44 
 
 
138 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  49.59 
 
 
131 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  50.39 
 
 
133 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  48.03 
 
 
150 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 
136 aa  120  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  47.62 
 
 
171 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8458  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  0.0186574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  46.34 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  46.88 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  48.78 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  44.12 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  47.33 
 
 
151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  49.59 
 
 
142 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
137 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 
180 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  46.4 
 
 
155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  44.72 
 
 
141 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 
138 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  48.84 
 
 
138 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  47.97 
 
 
142 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  46.21 
 
 
134 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  44.03 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 
134 aa  117  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  46.88 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  48.06 
 
 
132 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  44.88 
 
 
166 aa  115  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>