More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8458 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8458  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  0.0186574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  49.21 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  47.06 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  47.24 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  45.38 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  47.11 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  46.83 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  47.24 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  47.01 
 
 		 133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  47.2 
 
 		 141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  48.03 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  48.03 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  45.97 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  44.8 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  45.67 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  46.15 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  48.44 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  47.66 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  46.83 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  46.09 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  42.64 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  44.96 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  44.53 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  42.64 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  47.11 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  42.52 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  43.85 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  41.73 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  46.46 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  46.46 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  46.83 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  42.11 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  44.19 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  45.45 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  44.7 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  45.24 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  45.67 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  41.27 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  46.83 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  45.24 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  44.19 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  42.62 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  46.97 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  44.27 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  44.09 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  42.06 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  41.6 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  45.67 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  42.06 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  45.97 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  41.6 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  43.51 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  44.72 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  46.28 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  41.6 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  41.6 
 
 		 143 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  47.97 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  40.48 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  40.8 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  40.48 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  44.72 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  44.88 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  40.8 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  40.8 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  44.72 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  40.48 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  40.48 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  44.09 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  44.44 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  43.41 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  40.8 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  43.9 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  46.51 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  46.67 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  42.75 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  41.86 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  44.09 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1695  methionine-R-sulfoxide reductase  47.2 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  43.65 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  42.06 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  43.31 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  43.9 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  43.55 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  43.65 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  42.65 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  42.96 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  46.03 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2329  methionine sulfoxide reductase B  42.75 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1902  methionine-R-sulfoxide reductase  46.03 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  40.31 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  41.48 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  39.68 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  41.09 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  43.41 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  40.71 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1778  methionine-R-sulfoxide reductase  41.13 
 
 		 206 aa  118  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>