More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2267 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
146 aa  305  9e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  82.54 
 
 
146 aa  231  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  77.34 
 
 
136 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  77.17 
 
 
136 aa  209  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  72.18 
 
 
136 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  72.18 
 
 
136 aa  207  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  72.18 
 
 
136 aa  206  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  73.44 
 
 
136 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1768  methionine-R-sulfoxide reductase  71.09 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  65.71 
 
 
147 aa  190  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.704968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  72 
 
 
149 aa  190  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12940  methionine-R-sulfoxide reductase  70.16 
 
 
171 aa  189  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0480149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24060  methionine-R-sulfoxide reductase  69.6 
 
 
141 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0197494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2259  methionine-R-sulfoxide reductase  69.84 
 
 
133 aa  186  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.128269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1661  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 
161 aa  184  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.626292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1565  methionine-R-sulfoxide reductase  71.67 
 
 
142 aa  184  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6715  Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase  68 
 
 
133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.264414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1654  methionine-R-sulfoxide reductase  68 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000138468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0820  methionine-R-sulfoxide reductase  59.57 
 
 
144 aa  180  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1379  methionine-R-sulfoxide reductase  67.2 
 
 
133 aa  176  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.217446  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  66.14 
 
 
140 aa  175  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1893  methionine sulfoxide reductase B  63.71 
 
 
140 aa  168  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0416766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13770  methionine-R-sulfoxide reductase  60.98 
 
 
148 aa  168  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  63.28 
 
 
133 aa  168  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
133 aa  166  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1542  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 
148 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15640  methionine-R-sulfoxide reductase  59.54 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.825973  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 
131 aa  160  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  59.56 
 
 
141 aa  159  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0693  protein-methionine-S-oxide reductase  53.38 
 
 
141 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0153772  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 
133 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0718  hypothetical protein  50.75 
 
 
141 aa  154  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139973  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3910  methionine-R-sulfoxide reductase  61.24 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1485  methionine-R-sulfoxide reductase  58.91 
 
 
136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.476071  hitchhiker  0.000138534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0816  methionine-R-sulfoxide reductase  57.69 
 
 
140 aa  153  9e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000926908  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  59.2 
 
 
131 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7390  methionine-R-sulfoxide reductase  55.38 
 
 
136 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.508661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
142 aa  147  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  54.4 
 
 
145 aa  147  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51697  predicted protein  52 
 
 
133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
137 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  51.39 
 
 
147 aa  144  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.2 
 
 
134 aa  142  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  52.24 
 
 
134 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  48.53 
 
 
189 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
141 aa  140  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  56 
 
 
132 aa  140  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  54.84 
 
 
131 aa  140  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04990  protein-methionine-R-oxide reductase, putative  50 
 
 
134 aa  140  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.296874  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  56.69 
 
 
132 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  50.76 
 
 
133 aa  140  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 
159 aa  140  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  51.59 
 
 
137 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  54.4 
 
 
131 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 
137 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  49.65 
 
 
148 aa  139  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50.77 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  52.27 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  48.57 
 
 
139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  54.84 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  50.75 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  50.75 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
136 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  51.61 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  55.65 
 
 
134 aa  137  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
143 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  51.22 
 
 
128 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
143 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  52.03 
 
 
128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.89 
 
 
185 aa  135  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  49.25 
 
 
143 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  50.34 
 
 
150 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  53.23 
 
 
137 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  53.23 
 
 
142 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  53.97 
 
 
137 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  48.51 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  52.85 
 
 
143 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.03 
 
 
151 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  52.31 
 
 
136 aa  134  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  51.59 
 
 
136 aa  134  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 
133 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.18 
 
 
142 aa  134  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  51.22 
 
 
143 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5357  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 
171 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240425  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  48.78 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  53.08 
 
 
140 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  53.17 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  48.91 
 
 
138 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  49.62 
 
 
135 aa  133  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>