More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2262 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  100 
 
 
139 aa  293  6e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  96.4 
 
 
139 aa  285  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  76.19 
 
 
137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2214  methionine-R-sulfoxide reductase  77.78 
 
 
138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1972  methionine-R-sulfoxide reductase  69.78 
 
 
156 aa  207  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  70.4 
 
 
137 aa  203  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  70.4 
 
 
137 aa  203  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  70.4 
 
 
137 aa  203  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  71.2 
 
 
137 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  71.2 
 
 
137 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  71.2 
 
 
137 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  71.2 
 
 
137 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  201  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  71.2 
 
 
137 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  201  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  66.19 
 
 
137 aa  200  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  72.58 
 
 
137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  68.42 
 
 
136 aa  175  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  67.54 
 
 
166 aa  173  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  64.35 
 
 
134 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  61.42 
 
 
147 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27510  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 
132 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156355  normal  0.0230939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2328  methionine sulfoxide reductase B  60.66 
 
 
132 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  52.67 
 
 
135 aa  150  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  61.95 
 
 
141 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  63.72 
 
 
133 aa  148  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  56.9 
 
 
142 aa  146  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  57.76 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  53.79 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  59.65 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 
139 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  57.76 
 
 
131 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  56.52 
 
 
131 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  55.17 
 
 
138 aa  140  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  57.39 
 
 
133 aa  140  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  51.94 
 
 
146 aa  139  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  59.29 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1350  protein-methionine-S-oxide reductase  55.65 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000258473  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  54.39 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  52.89 
 
 
142 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  55.56 
 
 
136 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.88 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.26 
 
 
159 aa  136  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  57.52 
 
 
133 aa  136  8.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
132 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  55.75 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  51.24 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  53.1 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5230  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 
321 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  53.51 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  51.54 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  54.39 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  50.86 
 
 
128 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3954  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  51.64 
 
 
321 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5132  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.82 
 
 
321 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0809549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5531  peptide methionine sulfoxide reductase  50.82 
 
 
321 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  53.98 
 
 
138 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5561  peptide methionine sulfoxide reductase  50.82 
 
 
321 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5115  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.82 
 
 
321 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5617  peptide methionine sulfoxide reductase  50.82 
 
 
321 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5569  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50.82 
 
 
321 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5388  peptide methionine sulfoxide reductase  50.82 
 
 
321 aa  133  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.52931  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50.86 
 
 
128 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 
136 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  48.82 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.64 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  53.51 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50.86 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5290  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  54.24 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5687  bifunctional methionine sulfoxide reductase A/B protein  50 
 
 
321 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  53.21 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  51.75 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.22 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  46.62 
 
 
133 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  48.82 
 
 
131 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  53.1 
 
 
141 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  53.1 
 
 
141 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  54.78 
 
 
133 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2458  methionine-R-sulfoxide reductase  48.85 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  48.53 
 
 
155 aa  130  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  52.29 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  48.36 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  51.89 
 
 
154 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  50 
 
 
137 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 
135 aa  129  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  48.09 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  52.63 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  46.92 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>