More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2396 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2396  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 140 aa  298  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.121368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  65.19 
 
 		 136 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  65.19 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  62.22 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1676  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2028  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 		 137 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  60.15 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3301  methionine-R-sulfoxide reductase  60.74 
 
 		 137 aa  165  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 		 167 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  55.73 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  59.69 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1767  methionine-S-oxide reductase  55.97 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  55.04 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  58.46 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1761  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 		 198 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2097  methionine-R-sulfoxide reductase  54.14 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.3057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 		 133 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  53.38 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  57.58 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  50.36 
 
 		 133 aa  153  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  52.55 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  52.99 
 
 		 131 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  54.14 
 
 		 140 aa  151  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  52.24 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  54.33 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  54.14 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.72 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2240  methionine-R-sulfoxide reductase  53.68 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1365  methionine-R-sulfoxide reductase  51.43 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  52.99 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  48.91 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1897  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1827  methionine-R-sulfoxide reductase  52.63 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.186679  normal  0.561809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  49.25 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6170  protein-methionine-S-oxide reductase  51.88 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1909  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  54.2 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5210  protein-methionine-S-oxide reductase  51.88 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1932  methionine-R-sulfoxide reductase  51.88 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0939518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  49.62 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  51.88 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  48.89 
 
 		 133 aa  144  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1589  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  48.51 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 		 177 aa  142  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  50.37 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  52.24 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  50 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 164 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  50.77 
 
 		 133 aa  141  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  50.82 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  47.41 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1706  peptide methionine sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0428865  normal  0.0200729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3481  methionine-R-sulfoxide reductase  51.47 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 		 166 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50.77 
 
 		 144 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 167 aa  140  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  51.16 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2139  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.142771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  51.13 
 
 		 131 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  52.5 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  48.87 
 
 		 135 aa  140  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 		 137 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  47.76 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  52.46 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1205  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  49.25 
 
 		 137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  50.38 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  50.38 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1932  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1441  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3373  methionine-R-sulfoxide reductase  52.27 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  52.55 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1663  methionine sulfoxide reductase B  48.87 
 
 		 165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623127  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  46.67 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2337  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2298  methionine-R-sulfoxide reductase  51.52 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.52536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>