More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2558 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2558  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
141 aa  290  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0971304  normal  0.867883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2945  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
141 aa  290  7e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03070  methionine sulfoxide reductase B  64.62 
 
 
154 aa  181  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3401  methionine sulfoxide reductase B  59.57 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0440  methionine sulfoxide reductase B  63.85 
 
 
155 aa  175  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2001  methionine sulfoxide reductase B  59.4 
 
 
201 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1925  methionine sulfoxide reductase B  59.4 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0476823  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3166  methionine sulfoxide reductase B  58.82 
 
 
163 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01747  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0193587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1864  methionine-R-sulfoxide reductase  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000480706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1413  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133391  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1863  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000150257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1854  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0487085  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2502  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01735  hypothetical protein  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2002  methionine sulfoxide reductase B  58.47 
 
 
137 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00962024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  62.39 
 
 
140 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  59.17 
 
 
137 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  61.86 
 
 
140 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  59.17 
 
 
137 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  61.02 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  55.74 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  54.55 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1676  methionine sulfoxide reductase B  54.24 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000216334  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03048  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1884  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000227022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2095  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000449437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2350  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167897  normal  0.0377518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  59.32 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  57.26 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1986  methionine sulfoxide reductase B  57.14 
 
 
137 aa  143  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000131447  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2065  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.717826  hitchhiker  0.00120288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 
135 aa  142  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  54.55 
 
 
135 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1385  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0497198  normal  0.454415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  57.14 
 
 
135 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1418  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.445758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  60.83 
 
 
159 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1402  methionine sulfoxide reductase B  55.93 
 
 
137 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.270927  hitchhiker  0.0051199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  56.2 
 
 
136 aa  140  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002909  peptide methionine sulfoxide reductase msrB  52.38 
 
 
136 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000132728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  57.98 
 
 
183 aa  140  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  55.81 
 
 
132 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  55.46 
 
 
133 aa  140  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  55.37 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  55.83 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1850  methionine sulfoxide reductase B  49.28 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  54.03 
 
 
136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  52.1 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  53.78 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  51.09 
 
 
171 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  55.37 
 
 
138 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
137 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2975  protein-methionine-S-oxide reductase  58.41 
 
 
135 aa  137  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0725689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 
151 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0705  methionine-R-sulfoxide reductase  54.24 
 
 
137 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.906192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  48.48 
 
 
154 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  55.46 
 
 
136 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  54.62 
 
 
131 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  53.28 
 
 
131 aa  136  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1955  peptide methionine sulfoxide reductase, putative  50.75 
 
 
202 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.81622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1165  protein-methionine-S-oxide reductase  53.91 
 
 
134 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  52.94 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1873  methionine sulfoxide reductase B  53.78 
 
 
131 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0253598  normal  0.296694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3821  methionine sulfoxide reductase B  54.92 
 
 
165 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631036  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  52.59 
 
 
134 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  53.28 
 
 
144 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2727  methionine sulfoxide reductase B  52.59 
 
 
137 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00340114  hitchhiker  0.000973633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0125  methionine sulfoxide reductase B  54.1 
 
 
147 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.155409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  46.72 
 
 
185 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.2 
 
 
141 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.61 
 
 
139 aa  133  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1966  methionine sulfoxide reductase B  48.91 
 
 
139 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0169175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.37 
 
 
177 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  56.14 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  47.14 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  52.1 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  55.56 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  50.74 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  52.5 
 
 
189 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  49.26 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1533  methionine-R-sulfoxide reductase  51.85 
 
 
167 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  53.45 
 
 
131 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  50.82 
 
 
136 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5350  methionine sulfoxide reductase B  53.28 
 
 
147 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  51.67 
 
 
154 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2262  methionine sulfoxide reductase B  53.1 
 
 
139 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00190122  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3842  methionine sulfoxide reductase B  52.94 
 
 
131 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0499897  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  56.67 
 
 
136 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  47.14 
 
 
167 aa  130  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1584  methionine sulfoxide reductase B  53.91 
 
 
147 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000628294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 
138 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3024  methionine-R-sulfoxide reductase  55.75 
 
 
127 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0106667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  53.45 
 
 
131 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  53.66 
 
 
180 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  52.59 
 
 
138 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2424  methionine-R-sulfoxide reductase  52.54 
 
 
158 aa  130  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.072868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>