More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0323 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  100 
 
 		 440 aa  843    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  31.46 
 
 		 437 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.02 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.22 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  31.44 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  28.31 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  28.31 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  28.31 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  28.31 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  28.08 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  26.93 
 
 		 448 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25.97 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  31.59 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  27.85 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  27.85 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  27.1 
 
 		 432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  27.63 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.14 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  28.83 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.71 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.71 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.91 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.41 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.4 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  27.63 
 
 		 551 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.83 
 
 		 428 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  28.7 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  26.46 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  28.6 
 
 		 544 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  27.36 
 
 		 445 aa  134  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  26.98 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  28.7 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  28 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.97 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.8 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  27.68 
 
 		 488 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  26.95 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0149  trigger factor domain  28.95 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000935038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  27.93 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  26.71 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  25.7 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  26.98 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.5 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.11 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.34 
 
 		 428 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  26.24 
 
 		 513 aa  127  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  24.87 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  26.05 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  26.47 
 
 		 512 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  25.7 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  26.56 
 
 		 444 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  26.29 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  23.53 
 
 		 432 aa  122  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  26.11 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  28.08 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  25.35 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  27.5 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  26.32 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  25.41 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  26.06 
 
 		 432 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  26.11 
 
 		 447 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  26.75 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  26.62 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  25.82 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.46 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  26.75 
 
 		 443 aa  120  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  25.78 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  26.44 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  25.12 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.21 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  25.4 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  28.47 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  25.59 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.38 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  25.4 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.23 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  27.83 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.23 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  28.84 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  25 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  24.77 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  25.82 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  28.19 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  27.7 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  25.89 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  26.17 
 
 		 491 aa  116  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  25.11 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3336  trigger factor  24.4 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>