233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0149 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0149  trigger factor domain  100 
 
 		 456 aa  892    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000935038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  28.95 
 
 		 440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  23.73 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  23.4 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  26.17 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  26.47 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  27.65 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  26.04 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  26.56 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1708  trigger factor domain-containing protein  29.01 
 
 		 460 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  27.46 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.12 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.12 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  24.8 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  29.23 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  24.87 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  26.44 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.39 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  26.42 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  27.42 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  24.29 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  28.25 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  24.1 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.15 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  24.28 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  24.44 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.51 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  25.87 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  24.06 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  25.23 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  23.9 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.32 
 
 		 427 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.57 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  23.99 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  24.05 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  27.72 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  23.13 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  23.13 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  23.13 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  23.13 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  23.13 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  25.33 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  26.59 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0761  trigger factor  21.88 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  26.88 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  25.54 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  24.83 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  25.63 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  25.74 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  23.93 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  22.15 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  26.44 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  21.9 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  21.9 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  21.9 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  27.49 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0234  trigger factor domain-containing protein  25.86 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0632547  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0236  trigger factor domain-containing protein  25.86 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  22.51 
 
 		 436 aa  59.7  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.87 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  25.37 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  25.33 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  24.83 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1671  trigger factor  23.32 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  21.82 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  24.83 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  27.07 
 
 		 500 aa  57.4  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  25.95 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  21.31 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  27.8 
 
 		 459 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  23.88 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  29.28 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  22.47 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  23.78 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  22.33 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  22.25 
 
 		 452 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  24.7 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  21.29 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  23.53 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_002620  TC0080  trigger factor  25.33 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0356919  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  26.21 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.92 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  26.21 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.58 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  23.58 
 
 		 459 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  23.34 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  22.83 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  21.39 
 
 		 440 aa  54.7  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  26.37 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  22 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  26.37 
 
 		 429 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.77 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>