More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3518 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  100 
 
 		 471 aa  923    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  58.28 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  59.95 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  56.76 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  55.81 
 
 		 470 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  58.92 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  54.45 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  56.54 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  56.67 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  50.44 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  53.7 
 
 		 519 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  49.18 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  50.8 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  49.47 
 
 		 479 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  52.39 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  48.06 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  47.8 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  48.31 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  47.26 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  48.07 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  48.07 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  48.07 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  46.85 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  46.78 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  45.89 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  48.07 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  46.74 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  46.7 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  45.54 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  47.15 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  44.19 
 
 		 468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  46.24 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  46.47 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  45.16 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  44.69 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  44.88 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  42.43 
 
 		 449 aa  333  3e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  41.4 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.4 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.21 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.91 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.36 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.7 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.04 
 
 		 429 aa  177  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  31.21 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.23 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.7 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.18 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.86 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.32 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.91 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.86 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.7 
 
 		 427 aa  160  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.26 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.57 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.52 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.06 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  29.64 
 
 		 437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.5 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.25 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  25.9 
 
 		 436 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  28.8 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  30.46 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.64 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  25.83 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  28.8 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  29.1 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.23 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.46 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.07 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.37 
 
 		 500 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.37 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  25.63 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.66 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  28.84 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  30.28 
 
 		 428 aa  143  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  29.81 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.5 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  25.41 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  25.41 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.7 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.5 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  27.42 
 
 		 427 aa  140  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  25.23 
 
 		 433 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.26 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.3 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  30.7 
 
 		 434 aa  136  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  27.4 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  27.86 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.56 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  27.94 
 
 		 430 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.13 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>