More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1850 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  100 
 
 		 513 aa  989    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  59.19 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  57.69 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  55.71 
 
 		 454 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  55.65 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  53.12 
 
 		 461 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  54.57 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  54.57 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  54.57 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  54.34 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  49.19 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  51.14 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  50.44 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  49.65 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  49.66 
 
 		 491 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  50.92 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  48.96 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  48.39 
 
 		 481 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  51.16 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  50.23 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  46.92 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  48.72 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  46.38 
 
 		 466 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  44.78 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  46.14 
 
 		 464 aa  382  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  43.71 
 
 		 468 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.82 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  45.79 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  45.8 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  46.56 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  43.94 
 
 		 463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  44.39 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  44.02 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  42.66 
 
 		 455 aa  333  6e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  42.95 
 
 		 519 aa  321  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  41.27 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  39.95 
 
 		 459 aa  299  9e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  38.06 
 
 		 449 aa  283  5.000000000000001e-75  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.9 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.34 
 
 		 438 aa  203  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.89 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  26.87 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.06 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.11 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.49 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.49 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  27.48 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  30.11 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  29.3 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.33 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.25 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  29.03 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  28.8 
 
 		 488 aa  172  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  30.5 
 
 		 437 aa  169  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.05 
 
 		 448 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.72 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.57 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.12 
 
 		 436 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  28.49 
 
 		 428 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.53 
 
 		 428 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.7 
 
 		 436 aa  163  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.07 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  26.34 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  31.12 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.36 
 
 		 431 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  26 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.15 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.15 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  31.12 
 
 		 428 aa  161  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.08 
 
 		 445 aa  159  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.51 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  25.5 
 
 		 426 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.63 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  25.93 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  26.54 
 
 		 433 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.99 
 
 		 435 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  29.83 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.73 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.23 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  25.75 
 
 		 437 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  27.31 
 
 		 435 aa  150  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.57 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29 
 
 		 460 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.52 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  34.19 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  25 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  24.93 
 
 		 433 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.33 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.98 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  35.42 
 
 		 436 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.86 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>