More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1874 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  874    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  68.45 
 
 		 431 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  57.51 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  57.14 
 
 		 435 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  56.45 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  45.79 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  46.08 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  43.78 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.28 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  40.05 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  39.26 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  39.95 
 
 		 428 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  38.37 
 
 		 427 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  42.94 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  37.91 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.64 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  38.6 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  34.72 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  38.37 
 
 		 425 aa  255  9e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  36.12 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  35.68 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  33.41 
 
 		 448 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  35.89 
 
 		 435 aa  249  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  35.51 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.73 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  35.66 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  36.41 
 
 		 436 aa  246  6e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  33.26 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  33.64 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  33.64 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  33.94 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  36.63 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  34.48 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  35.91 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  36.51 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  36.3 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  37.19 
 
 		 446 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  35.08 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  35.08 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  35.57 
 
 		 436 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  37.47 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.02 
 
 		 436 aa  236  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  35.57 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  34.95 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  36.16 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  36.38 
 
 		 437 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  33.71 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.18 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.12 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  34.78 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  35.8 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  38.78 
 
 		 427 aa  230  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  35.73 
 
 		 427 aa  229  9e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  36.07 
 
 		 443 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  35.86 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  32.87 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  32.64 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.79 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  35.84 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  35.01 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  32.63 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.02 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  34.4 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  35.54 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.58 
 
 		 471 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  34.58 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.88 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  32.63 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  34.17 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.76 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  29.7 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  31.12 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  31.31 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  35.03 
 
 		 513 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  32.4 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.49 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.93 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  33.03 
 
 		 544 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.93 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  37.02 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.49 
 
 		 434 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  34.4 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  34.93 
 
 		 451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.31 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.41 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.95 
 
 		 444 aa  216  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  32.95 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>