More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1549 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  100 
 
 		 463 aa  925    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  50.33 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  48.07 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  47.36 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  48.65 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  48.63 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  47.01 
 
 		 460 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  44.99 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  46.09 
 
 		 518 aa  391  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  45.23 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  45.23 
 
 		 478 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  44.67 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  45.35 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  47.07 
 
 		 445 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  45.9 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  45.68 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  43.46 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  45.01 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  43.95 
 
 		 454 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  42.34 
 
 		 476 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  41.59 
 
 		 494 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  40.22 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  44.06 
 
 		 513 aa  359  6e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  41.32 
 
 		 495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  44.62 
 
 		 459 aa  355  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  41.91 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  45.12 
 
 		 443 aa  352  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  41.19 
 
 		 551 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  45.17 
 
 		 442 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  40.18 
 
 		 452 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  40.31 
 
 		 453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  42.2 
 
 		 544 aa  339  5e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  40.84 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  43.51 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  39.91 
 
 		 453 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  37.86 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  40.53 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  39.25 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  42.82 
 
 		 444 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  42.82 
 
 		 444 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  41.91 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  39.26 
 
 		 448 aa  283  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  38.44 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  37.28 
 
 		 435 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  35.68 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  37.3 
 
 		 436 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  38.12 
 
 		 436 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  37.5 
 
 		 437 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  37.95 
 
 		 437 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  36.45 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  37.53 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  36.18 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  37.44 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  37.27 
 
 		 443 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  34.85 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  37.27 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  36.53 
 
 		 433 aa  251  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  35 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  34.85 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.18 
 
 		 442 aa  247  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  35.96 
 
 		 436 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  33.33 
 
 		 435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  34.77 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.88 
 
 		 436 aa  246  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  33.64 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  34.17 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  36.3 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.86 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  35.08 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  35.08 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.18 
 
 		 434 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  34.85 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.95 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  33.63 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  35.54 
 
 		 435 aa  236  9e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.56 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  33.26 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.25 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.67 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  33.94 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  33.8 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  33.57 
 
 		 437 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  33.03 
 
 		 434 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.33 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  35 
 
 		 434 aa  230  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  34.4 
 
 		 434 aa  230  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  34.17 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  34.17 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  34.17 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  32.12 
 
 		 434 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  31.66 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.7 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  33.11 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>