More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0652 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  100 
 
 		 436 aa  874    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  61.68 
 
 		 449 aa  504  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  55.63 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  55.74 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  53.86 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  55.58 
 
 		 431 aa  451  1e-125  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  51.76 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  52.93 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  52.22 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  52.02 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  52.11 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  51.88 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  51.64 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  47.44 
 
 		 433 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  47.91 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  47.91 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  43.88 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  45.12 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  44.7 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  43.99 
 
 		 428 aa  336  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  42.45 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  42.65 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.19 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  43.24 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  39.34 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  40.14 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  37.91 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  37.35 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  39.04 
 
 		 438 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  39.61 
 
 		 426 aa  295  8e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  39.81 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  39.4 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.7 
 
 		 435 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  36.17 
 
 		 478 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  38.86 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.75 
 
 		 435 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  35.98 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  36.41 
 
 		 433 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  36.45 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.12 
 
 		 488 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.06 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  34.07 
 
 		 439 aa  226  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.86 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.33 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  33.17 
 
 		 471 aa  223  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.71 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.49 
 
 		 500 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  33.92 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  33.01 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  33.01 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  33.01 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.89 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  33.01 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  33.67 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  33.67 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.95 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  33.25 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.86 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  33.42 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  34.47 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  34.47 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.66 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  34.47 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  34.47 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  36.86 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  34.47 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  32.35 
 
 		 460 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  33.17 
 
 		 434 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  34.21 
 
 		 432 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  36.1 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  28.87 
 
 		 447 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.75 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  33.95 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.83 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.03 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  31.42 
 
 		 479 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.01 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  29.91 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.91 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  35.16 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.72 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  33.01 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>