More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0191 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0105  trigger factor  81.97 
 
 
427 aa  710    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  100 
 
 
427 aa  849    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  69.09 
 
 
427 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  53.86 
 
 
436 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  54.82 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  51.4 
 
 
439 aa  415  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  51.79 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  48.83 
 
 
428 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  49.53 
 
 
428 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  45.67 
 
 
433 aa  378  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  45.67 
 
 
433 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  45.67 
 
 
433 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  47.54 
 
 
427 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  47.65 
 
 
425 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  46.71 
 
 
425 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  46.48 
 
 
425 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  42.99 
 
 
446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  40.28 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  44.76 
 
 
428 aa  319  7e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  42.3 
 
 
435 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  40.32 
 
 
428 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.24 
 
 
429 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  39.3 
 
 
432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  38.93 
 
 
438 aa  285  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  42.41 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  37.12 
 
 
435 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  39.18 
 
 
426 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  40.69 
 
 
428 aa  275  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  36.28 
 
 
438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  39.11 
 
 
446 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  35.73 
 
 
438 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.12 
 
 
428 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  42.12 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.8 
 
 
433 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  33.72 
 
 
435 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.43 
 
 
488 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  33.18 
 
 
435 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  34.75 
 
 
430 aa  220  3e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.92 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.07 
 
 
442 aa  210  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.72 
 
 
433 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  33.49 
 
 
426 aa  207  4e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  36.56 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.8 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  35 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.8 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.72 
 
 
433 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.18 
 
 
478 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  33.1 
 
 
432 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.65 
 
 
436 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.33 
 
 
434 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.87 
 
 
435 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  32.91 
 
 
437 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  32.66 
 
 
443 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.65 
 
 
436 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  30.29 
 
 
473 aa  189  1e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.87 
 
 
432 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.87 
 
 
432 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.87 
 
 
432 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.64 
 
 
432 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  32.41 
 
 
437 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  32.41 
 
 
432 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.64 
 
 
432 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  32.41 
 
 
432 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.96 
 
 
434 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.96 
 
 
434 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.96 
 
 
434 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.9 
 
 
436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.74 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.14 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  32.18 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.32 
 
 
471 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  32.68 
 
 
428 aa  182  7e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.65 
 
 
434 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  33.25 
 
 
435 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  30.46 
 
 
461 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  32.64 
 
 
434 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.26 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.52 
 
 
454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.49 
 
 
434 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  32.11 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.56 
 
 
468 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  32.18 
 
 
434 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.18 
 
 
434 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.41 
 
 
483 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  29.62 
 
 
432 aa  176  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  30.34 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>