More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1730 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  100 
 
 
439 aa  877    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  52.69 
 
 
431 aa  455  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  52.02 
 
 
436 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  53.41 
 
 
449 aa  431  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  52.22 
 
 
427 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  51.4 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  50.47 
 
 
427 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  44.52 
 
 
428 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  44.39 
 
 
427 aa  346  5e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  41.3 
 
 
433 aa  345  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  41.3 
 
 
433 aa  345  6e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  40.93 
 
 
433 aa  344  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  44.89 
 
 
428 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  44.39 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  43.43 
 
 
425 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  44.15 
 
 
425 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  44.15 
 
 
425 aa  334  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  43.19 
 
 
425 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  37.5 
 
 
429 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  37.59 
 
 
432 aa  285  8e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  37.79 
 
 
435 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  36.26 
 
 
435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  39.15 
 
 
428 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  38.71 
 
 
446 aa  279  7e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  37.47 
 
 
435 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  38.37 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  36.89 
 
 
451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  36.9 
 
 
428 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  36.75 
 
 
428 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  33.65 
 
 
438 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  35.39 
 
 
446 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  34.75 
 
 
438 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  38.02 
 
 
433 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  40.79 
 
 
428 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.91 
 
 
435 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  40.79 
 
 
428 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.31 
 
 
438 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.86 
 
 
433 aa  229  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.34 
 
 
435 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.08 
 
 
431 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.16 
 
 
478 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  32.6 
 
 
430 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.34 
 
 
488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.74 
 
 
442 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35 
 
 
439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.43 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.87 
 
 
434 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.79 
 
 
434 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.18 
 
 
434 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.75 
 
 
434 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.24 
 
 
424 aa  189  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.75 
 
 
434 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.75 
 
 
434 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.75 
 
 
434 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.47 
 
 
436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  29.89 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  29.89 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.17 
 
 
434 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  30.05 
 
 
434 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  29.66 
 
 
434 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  29.49 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  29.43 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.79 
 
 
434 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  28.7 
 
 
434 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30.65 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  29.79 
 
 
461 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  29.72 
 
 
434 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.71 
 
 
437 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30.41 
 
 
432 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  28.6 
 
 
434 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.03 
 
 
434 aa  176  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  30.86 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  28.74 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  29.26 
 
 
435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  29.53 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.18 
 
 
432 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  33.17 
 
 
431 aa  173  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.18 
 
 
432 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.18 
 
 
432 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  32.3 
 
 
439 aa  173  5e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.18 
 
 
432 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.18 
 
 
432 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.55 
 
 
432 aa  173  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  28.87 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  28.87 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  28.87 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  30.05 
 
 
426 aa  172  9e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.04 
 
 
455 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>