More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1460 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  100 
 
 		 461 aa  904    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  64.07 
 
 		 454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  58.7 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  60.41 
 
 		 482 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  60.41 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  60.41 
 
 		 478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  55.14 
 
 		 450 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  56.99 
 
 		 473 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  58.15 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  53.12 
 
 		 513 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  55.13 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  49.44 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  51.38 
 
 		 481 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  50.69 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  49.43 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  47.42 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  49.66 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  47.88 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  49.03 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  48.06 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  44.28 
 
 		 452 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  45.91 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  48.16 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  48.62 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  45.08 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  47.8 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  46.26 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  47.96 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  47.31 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  47.17 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  43.86 
 
 		 454 aa  363  5.0000000000000005e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  43.04 
 
 		 463 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  45.54 
 
 		 455 aa  356  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  46.7 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  42.89 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  44.55 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  43.31 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  41.52 
 
 		 449 aa  312  7.999999999999999e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  33.16 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.23 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.41 
 
 		 488 aa  233  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  37.43 
 
 		 446 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.87 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  31.55 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  37.47 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  35.96 
 
 		 478 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  36.08 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  36.08 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  36.32 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.61 
 
 		 425 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  34.92 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.44 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.07 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.58 
 
 		 428 aa  212  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  34.03 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.8 
 
 		 438 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  30.36 
 
 		 433 aa  206  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.3 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.74 
 
 		 438 aa  203  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.03 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.38 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.38 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  31.14 
 
 		 428 aa  196  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.41 
 
 		 432 aa  196  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  32.4 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.73 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  32.06 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.71 
 
 		 427 aa  189  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.96 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.2 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.62 
 
 		 428 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.41 
 
 		 435 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.62 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.46 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.5 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.37 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  29.79 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.92 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  30.25 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  32.2 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  28.87 
 
 		 437 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  31.51 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.98 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.35 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.47 
 
 		 437 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  32.94 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.21 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  29.77 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.11 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  30.8 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  29 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.22 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  30.67 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  30.99 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>