More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3500 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  95.54 
 
 		 448 aa  847    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  100 
 
 		 465 aa  921    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  50.23 
 
 		 479 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  49.19 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  49.66 
 
 		 450 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  50.81 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  49.43 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  50.57 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  46.59 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  48.5 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  46.91 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  47.49 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  46.43 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  46.43 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  48.97 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  46.43 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  45.09 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  48.18 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  47.96 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  46.64 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  46.4 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  46.47 
 
 		 471 aa  362  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  43.78 
 
 		 449 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  43.05 
 
 		 468 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  44.32 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  45.54 
 
 		 464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  42.63 
 
 		 463 aa  349  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  41.56 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  45.77 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  43.27 
 
 		 449 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  43.28 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  45.43 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  43.37 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  41.14 
 
 		 454 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  40.64 
 
 		 519 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  40.36 
 
 		 455 aa  300  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  37.05 
 
 		 459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  36.63 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.11 
 
 		 488 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  36.46 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.75 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.23 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.49 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.71 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.89 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.09 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.5 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.53 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.63 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.27 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.06 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.56 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.05 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.76 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.67 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.67 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.1 
 
 		 478 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.75 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.01 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.01 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.28 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.73 
 
 		 427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.73 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.01 
 
 		 425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.37 
 
 		 438 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.79 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.37 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.59 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.7 
 
 		 448 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.05 
 
 		 431 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.62 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  32.32 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.41 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  29.62 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.03 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  29.63 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.29 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  30.92 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.03 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.51 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  26.51 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  28.68 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.33 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  27.51 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.01 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  26.91 
 
 		 438 aa  156  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.61 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  28.18 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.63 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.28 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.52 
 
 		 437 aa  153  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  30 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.29 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.34 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  25.58 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>