More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2048 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  100 
 
 		 454 aa  898    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  63.33 
 
 		 461 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  61.89 
 
 		 479 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  61.42 
 
 		 478 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  61.42 
 
 		 482 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  61.42 
 
 		 478 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  58.61 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  57.84 
 
 		 479 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  57.11 
 
 		 450 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  55.71 
 
 		 513 aa  504  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  56.16 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  50.34 
 
 		 448 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  50.81 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  48.16 
 
 		 507 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  48.73 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  49.31 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  48.15 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  48.61 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  50 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  47.27 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  51.13 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  45.96 
 
 		 452 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  47.71 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  47.1 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  44.44 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  46.22 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  46.76 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  44.6 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  45.8 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  44.22 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  47.38 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  45.35 
 
 		 470 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  45.31 
 
 		 455 aa  355  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  45.62 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  44.32 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  44.72 
 
 		 469 aa  346  5e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  41.86 
 
 		 459 aa  318  9e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  39.6 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.55 
 
 		 429 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.41 
 
 		 488 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  30.57 
 
 		 435 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  31.79 
 
 		 438 aa  221  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.41 
 
 		 438 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.63 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  32.88 
 
 		 435 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.44 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  33.59 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.49 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.98 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.77 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.48 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.5 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.75 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.02 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.78 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.55 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.55 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.65 
 
 		 428 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.41 
 
 		 478 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.39 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.36 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.57 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.57 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.23 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.11 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.97 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.3 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.26 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  32.15 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.82 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  30.11 
 
 		 432 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  28.5 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.52 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.5 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.85 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.97 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  29.82 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  34.05 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.98 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.46 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  32.23 
 
 		 463 aa  173  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  30.48 
 
 		 437 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.25 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  30.18 
 
 		 433 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  29.53 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  27.38 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.73 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.83 
 
 		 428 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  30.47 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.19 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  30.18 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.23 
 
 		 500 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.63 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  29.17 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  30.71 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>