More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0736 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  100 
 
 
449 aa  877    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  47.47 
 
 
481 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  48.32 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  49.42 
 
 
483 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  45.7 
 
 
466 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  45.71 
 
 
463 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  44.6 
 
 
454 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  47.36 
 
 
463 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  44.93 
 
 
448 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  45.79 
 
 
513 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  45.62 
 
 
468 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  44.6 
 
 
491 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  45.96 
 
 
479 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  45.54 
 
 
471 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  43.85 
 
 
481 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  43.78 
 
 
465 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  43.57 
 
 
450 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  43.78 
 
 
473 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  46.21 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  42.14 
 
 
452 aa  352  8.999999999999999e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  42.45 
 
 
464 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  42.89 
 
 
461 aa  349  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  45.43 
 
 
460 aa  349  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  43.22 
 
 
479 aa  349  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  41.42 
 
 
482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  46.33 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  41.42 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  41.42 
 
 
478 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  44.04 
 
 
449 aa  336  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  42.63 
 
 
469 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  42.76 
 
 
466 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  43.25 
 
 
469 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  39.11 
 
 
454 aa  308  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  41.42 
 
 
455 aa  302  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  40.64 
 
 
458 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  38.5 
 
 
519 aa  286  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  37.32 
 
 
459 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  36.28 
 
 
449 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.24 
 
 
488 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.21 
 
 
446 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.7 
 
 
438 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.84 
 
 
425 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.21 
 
 
428 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.32 
 
 
429 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.5 
 
 
438 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  29.3 
 
 
425 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.03 
 
 
425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  29.03 
 
 
427 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.23 
 
 
425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.23 
 
 
425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.41 
 
 
478 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.21 
 
 
428 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31 
 
 
446 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.12 
 
 
435 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.09 
 
 
438 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.3 
 
 
428 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.33 
 
 
451 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.67 
 
 
435 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.28 
 
 
427 aa  168  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.7 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  25.85 
 
 
432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  25.91 
 
 
433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.19 
 
 
435 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  26.3 
 
 
428 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  25.91 
 
 
433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.16 
 
 
428 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  24.24 
 
 
426 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.7 
 
 
433 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  26.03 
 
 
428 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.18 
 
 
435 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.68 
 
 
427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  24.61 
 
 
428 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  27.91 
 
 
439 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.54 
 
 
433 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  27.75 
 
 
444 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.44 
 
 
436 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  27.64 
 
 
500 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.42 
 
 
427 aa  153  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  29.06 
 
 
436 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  29.95 
 
 
437 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.29 
 
 
431 aa  149  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  28.19 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.87 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.69 
 
 
440 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  29.86 
 
 
474 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.2 
 
 
430 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.25 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  29.23 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.7 
 
 
435 aa  146  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29 
 
 
429 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29 
 
 
429 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.55 
 
 
434 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.2 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  24.94 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  26.36 
 
 
460 aa  141  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>