More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1118 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  100 
 
 		 449 aa  884    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  73.94 
 
 		 469 aa  624  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  72.91 
 
 		 460 aa  623  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  71.56 
 
 		 455 aa  595  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  62.36 
 
 		 470 aa  541  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  58.97 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  55.9 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  54.42 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  56.67 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  56.35 
 
 		 519 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  50.82 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  50.23 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  47.93 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  47.41 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  45.26 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  48.53 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  47.01 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  46.87 
 
 		 473 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  45.39 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  46.85 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  45.8 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  47.39 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  47.39 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  47.39 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  45.8 
 
 		 466 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  46.38 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  45.54 
 
 		 481 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  43.43 
 
 		 448 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  45.31 
 
 		 483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  43.02 
 
 		 491 aa  339  8e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  43.94 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  43.36 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  43.38 
 
 		 507 aa  335  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  44.04 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  43.78 
 
 		 481 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  42.99 
 
 		 463 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  44.16 
 
 		 463 aa  326  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  44.83 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.43 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.2 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.93 
 
 		 436 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.33 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.24 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.09 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.38 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.81 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.61 
 
 		 429 aa  166  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  35.79 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  32.18 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  32.12 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.59 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.95 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  33.54 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.77 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  27.73 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  33.54 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.82 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.95 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  32.37 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  27.97 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.68 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  31.58 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  31.48 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.01 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.01 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  29.52 
 
 		 428 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.5 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  31.17 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  32.72 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.3 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.5 
 
 		 434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  32.21 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.48 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.72 
 
 		 436 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.45 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.5 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  31.69 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.34 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.35 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.69 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.28 
 
 		 431 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  30.03 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  30.79 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  30.79 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  33.77 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  25.46 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.99 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  31.99 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  30.72 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  31.45 
 
 		 434 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.5 
 
 		 441 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.97 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  30.36 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>