More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3400 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  100 
 
 		 481 aa  946    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  71.95 
 
 		 463 aa  624  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  63.82 
 
 		 481 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  53.24 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  50.23 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  48.38 
 
 		 507 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  49.43 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  50 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  53.47 
 
 		 471 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  49.53 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  46.99 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  45.93 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  48.61 
 
 		 513 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  47.45 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  47.65 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  44.84 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  46.4 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  47.6 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  45.13 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  43.57 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  44.61 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  44.77 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  44.98 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  44.77 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  44.21 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  43.79 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  43.51 
 
 		 470 aa  346  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  44.95 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  43.48 
 
 		 466 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  43.35 
 
 		 449 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  43.38 
 
 		 460 aa  335  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  43.81 
 
 		 454 aa  330  3e-89  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  42.11 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  43.35 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  42.66 
 
 		 455 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  41.5 
 
 		 459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  40.87 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  38.5 
 
 		 449 aa  295  8e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.75 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  33.03 
 
 		 438 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.98 
 
 		 435 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.37 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.13 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.89 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.04 
 
 		 427 aa  202  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.97 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.42 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.04 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.42 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.74 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.78 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.92 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.21 
 
 		 432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.67 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.17 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.9 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.23 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.67 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.67 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.83 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.99 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  32.63 
 
 		 478 aa  189  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.14 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.72 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.37 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  29 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.82 
 
 		 435 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.57 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.42 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  29.71 
 
 		 500 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  29.23 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.09 
 
 		 435 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.43 
 
 		 435 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.41 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.16 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  27.94 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.98 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  29.07 
 
 		 438 aa  166  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  26.81 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.88 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.98 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.16 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.27 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  27.23 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.02 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  27.76 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  28.92 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  27.55 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.28 
 
 		 448 aa  159  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  28.35 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  30.97 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  25.8 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  30 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>