More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0550 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  100 
 
 		 427 aa  852    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  70.49 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  69.09 
 
 		 427 aa  607  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  55.74 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  53.88 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  54.42 
 
 		 431 aa  422  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  50.47 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  51.98 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  51.4 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  51.28 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  51.05 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  50.59 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  50.82 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  50.59 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  45.2 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  45.67 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  45.67 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  44.55 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  42.92 
 
 		 446 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  39.58 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  39.95 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  40.51 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  39.53 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  40.7 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  36.28 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  40.14 
 
 		 426 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  38.6 
 
 		 432 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  38.17 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  38.6 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  40.05 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  35.73 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  37.76 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.94 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  42.94 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  36.21 
 
 		 488 aa  256  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  38.78 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.33 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.64 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  34.41 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.61 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  35.54 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  35.88 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.72 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  34.73 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.03 
 
 		 448 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.01 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.34 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.08 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  32.87 
 
 		 468 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  34.34 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  33.7 
 
 		 479 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  32.06 
 
 		 461 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.73 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  30.95 
 
 		 473 aa  194  2e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  32.3 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.57 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  34.09 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  31.91 
 
 		 481 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.66 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.7 
 
 		 424 aa  190  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.91 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.28 
 
 		 500 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  32.57 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.16 
 
 		 447 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.34 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  28.57 
 
 		 432 aa  186  8e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.58 
 
 		 441 aa  186  9e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.18 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  32.92 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  31.6 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.85 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.85 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  32.67 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.34 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  32.11 
 
 		 434 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  33.77 
 
 		 513 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  31.13 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  32.67 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.12 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  32.07 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  31.58 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  30.37 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.45 
 
 		 485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  32.34 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  32.34 
 
 		 434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  30.85 
 
 		 436 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.34 
 
 		 434 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  31.65 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.65 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  32.11 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  31.65 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  31.65 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  31.65 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.88 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>