More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2588 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  100 
 
 
428 aa  837    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  89.02 
 
 
428 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  72.13 
 
 
427 aa  604  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  70.52 
 
 
425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  70.05 
 
 
425 aa  585  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  70.52 
 
 
425 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  70.75 
 
 
425 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  70.52 
 
 
425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  70.28 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  70.28 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  70.28 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  70.28 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  70.28 
 
 
425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  60.24 
 
 
433 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  59.76 
 
 
433 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  59.76 
 
 
433 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  52.22 
 
 
436 aa  451  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  53.26 
 
 
435 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  52.21 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  56.51 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  51.4 
 
 
428 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  50.93 
 
 
429 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  50.7 
 
 
428 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  50.47 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  49.53 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  48.13 
 
 
427 aa  392  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  50.12 
 
 
426 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  51.28 
 
 
427 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  48.6 
 
 
432 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  48.71 
 
 
446 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  48.71 
 
 
428 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  45.22 
 
 
435 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  45.67 
 
 
438 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  52.09 
 
 
438 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  47.2 
 
 
431 aa  369  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  44.89 
 
 
439 aa  353  2e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  41.72 
 
 
438 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  45.22 
 
 
428 aa  328  8e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  44.76 
 
 
428 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  42.76 
 
 
451 aa  302  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  41.45 
 
 
430 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  38.6 
 
 
439 aa  280  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  39.95 
 
 
433 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  37.35 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  38.43 
 
 
435 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  40.14 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  38.43 
 
 
431 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  36.89 
 
 
433 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  37.5 
 
 
435 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  37.64 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  40.33 
 
 
433 aa  246  6.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  36.07 
 
 
500 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  35.32 
 
 
442 aa  242  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  33.1 
 
 
437 aa  237  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  33.63 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  33.73 
 
 
426 aa  232  9e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  33.48 
 
 
460 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  33.02 
 
 
447 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  33.8 
 
 
440 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  36.11 
 
 
461 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  34.36 
 
 
447 aa  226  8e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.94 
 
 
448 aa  225  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  36.04 
 
 
430 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.95 
 
 
448 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  33.8 
 
 
441 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.1 
 
 
434 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  34.29 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  35.17 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  34.93 
 
 
429 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  35.17 
 
 
429 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  35.62 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.11 
 
 
435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  31.93 
 
 
483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  32.74 
 
 
485 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  33.33 
 
 
500 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  31.08 
 
 
455 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  31.08 
 
 
455 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.72 
 
 
445 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  35.55 
 
 
433 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  35.97 
 
 
436 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  32.09 
 
 
436 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  33.49 
 
 
481 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  33 
 
 
435 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  34.14 
 
 
468 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.15 
 
 
479 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  35.62 
 
 
435 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  34.62 
 
 
432 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  31.4 
 
 
463 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  33.26 
 
 
434 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  33.9 
 
 
432 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.64 
 
 
444 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  34.38 
 
 
432 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  33.93 
 
 
447 aa  205  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>