More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0109 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  100 
 
 		 432 aa  875    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  76.74 
 
 		 433 aa  702    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  67.92 
 
 		 438 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  56.94 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  50.35 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  49.42 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.56 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.64 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.97 
 
 		 437 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.28 
 
 		 435 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.59 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  30.16 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.24 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  27.61 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.11 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.4 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  29.53 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.93 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.07 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.75 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.04 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  26.82 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  29.28 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.64 
 
 		 488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  28.8 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  27.01 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  28.54 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  27.29 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  27.59 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  27.75 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.88 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.01 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  25.18 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.91 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.57 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  26.05 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  27.51 
 
 		 465 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.15 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  28.31 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.44 
 
 		 448 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  28.04 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  30.79 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  27.97 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.95 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  25.95 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  29.38 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  28.14 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  28.03 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  26.65 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  30.99 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  28.16 
 
 		 518 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.09 
 
 		 426 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  29.92 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  27.06 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  28.97 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  29.43 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  27.56 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  29.78 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  25.51 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  26.67 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  28.8 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  29.43 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  29.36 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  29.43 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.14 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  27.55 
 
 		 481 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  25 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  23.97 
 
 		 437 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  26.61 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  23.97 
 
 		 437 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  27.67 
 
 		 436 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.78 
 
 		 435 aa  150  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  27.84 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  26.68 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  25.99 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  27.73 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  26.7 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  27.39 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  26.76 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  25.64 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  28.32 
 
 		 443 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.4 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  27.4 
 
 		 434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  26.45 
 
 		 429 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  26.24 
 
 		 428 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  25.94 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  25.94 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  26.45 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  27.29 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  26.96 
 
 		 436 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  25.29 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  27.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  27.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  27.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.13 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  26.68 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  26.17 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  26.22 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>