More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5275 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  79.74 
 
 		 483 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  100 
 
 		 507 aa  990    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  51.12 
 
 		 450 aa  445  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  50.46 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  50.69 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  48.63 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  48.38 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  50.23 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  48.96 
 
 		 513 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  48.32 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  48.99 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  48.26 
 
 		 481 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  48.62 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  46.91 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  46.68 
 
 		 448 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  49.1 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  44.8 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  44.79 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  44.23 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  44.34 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  44.8 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  45.76 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  45.05 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  45.05 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  45.05 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.07 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  44.39 
 
 		 454 aa  356  6.999999999999999e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  43.05 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  42.11 
 
 		 470 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  43.38 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  42.07 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  42.5 
 
 		 460 aa  332  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  42.26 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  40.58 
 
 		 519 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  39.18 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  39.41 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  36.99 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  36.76 
 
 		 449 aa  269  8.999999999999999e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.27 
 
 		 488 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.41 
 
 		 429 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.98 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.02 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.64 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.56 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.56 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.75 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.17 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.64 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  36.43 
 
 		 478 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.41 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.08 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.61 
 
 		 446 aa  199  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.17 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.47 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.31 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.24 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.19 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.81 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.24 
 
 		 428 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.05 
 
 		 426 aa  190  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.04 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.37 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.4 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  29.12 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.07 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.37 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.33 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.31 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.52 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.18 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  27.29 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.95 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.05 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.09 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  27.9 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.32 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.02 
 
 		 436 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.32 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.53 
 
 		 435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.93 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.98 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  25.99 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  28.14 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  30.46 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  35.03 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  27.79 
 
 		 440 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  29.17 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  29.4 
 
 		 472 aa  153  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  27.12 
 
 		 428 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.24 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  27.38 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.21 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>