More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1253 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  100 
 
 		 472 aa  936    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  98.31 
 
 		 472 aa  920    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  61.68 
 
 		 471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  55.83 
 
 		 447 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  56.24 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  57.69 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  54.27 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  52.73 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  51.61 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  51.14 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  39.36 
 
 		 471 aa  333  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  36.43 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  36.06 
 
 		 460 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  35.48 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  35.21 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  35 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  32.64 
 
 		 455 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  32.64 
 
 		 455 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  30.93 
 
 		 433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.93 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.93 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.12 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.91 
 
 		 488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.9 
 
 		 429 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.59 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.61 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.61 
 
 		 425 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.16 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.65 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.38 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  26.75 
 
 		 436 aa  183  6e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  31.1 
 
 		 432 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.47 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.36 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.05 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.01 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  29.43 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.68 
 
 		 426 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.64 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  26.93 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.08 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.71 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.14 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.38 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.93 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.84 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  31.81 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  32.84 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  29.55 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.67 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.29 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  26.25 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.14 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.07 
 
 		 440 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  32.64 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  32.05 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  32.05 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  32.05 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.08 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.18 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.18 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  29.4 
 
 		 507 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.38 
 
 		 428 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  33.14 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  27.87 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.02 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  29.65 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  29.65 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.84 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  29.92 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  29.38 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.93 
 
 		 439 aa  150  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.34 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  28.35 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  30.87 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  24.42 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.01 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  30.53 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  27.48 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  29.38 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  29.26 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  23.98 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  28.23 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  29.34 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.26 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>