More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3500 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  100 
 
 
429 aa  837    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  99.77 
 
 
429 aa  835    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  82.01 
 
 
430 aa  707    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  96.97 
 
 
429 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.45 
 
 
435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.79 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.58 
 
 
435 aa  260  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.28 
 
 
439 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.41 
 
 
431 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.64 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  35.2 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  36.21 
 
 
428 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.61 
 
 
437 aa  226  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  37.07 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  36.21 
 
 
435 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  31.41 
 
 
428 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  30.39 
 
 
440 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.47 
 
 
427 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.17 
 
 
428 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  33.49 
 
 
438 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.02 
 
 
429 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  35.17 
 
 
428 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  34.13 
 
 
425 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  36.65 
 
 
432 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  34.61 
 
 
446 aa  206  9e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.54 
 
 
443 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  32.62 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.24 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.17 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  32.55 
 
 
426 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.79 
 
 
442 aa  190  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.71 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  33.49 
 
 
451 aa  189  7e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.3 
 
 
433 aa  189  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.71 
 
 
435 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.23 
 
 
428 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.36 
 
 
446 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.85 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.85 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.67 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.07 
 
 
427 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.35 
 
 
438 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.77 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.84 
 
 
436 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.3 
 
 
435 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  35.03 
 
 
434 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.47 
 
 
436 aa  177  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  32.02 
 
 
449 aa  176  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  27.27 
 
 
434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.55 
 
 
441 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.11 
 
 
427 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  31.6 
 
 
469 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.8 
 
 
444 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  29.86 
 
 
452 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.38 
 
 
434 aa  169  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.28 
 
 
436 aa  169  7e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.33 
 
 
484 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.28 
 
 
488 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  32.9 
 
 
436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.63 
 
 
448 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  29.95 
 
 
438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  27.61 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  30.02 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  32.12 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.39 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.6 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  31.62 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.67 
 
 
437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  31.62 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.47 
 
 
471 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  27.59 
 
 
439 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.75 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  33.73 
 
 
436 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  27.17 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  27.17 
 
 
434 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  27.17 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.58 
 
 
437 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  26.34 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  27.17 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.98 
 
 
427 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  27.17 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  31.11 
 
 
436 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  30.11 
 
 
434 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  26.93 
 
 
434 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  27.94 
 
 
432 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  32.02 
 
 
437 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  29.2 
 
 
512 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  31.38 
 
 
447 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  29.37 
 
 
436 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  32.32 
 
 
449 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  29.32 
 
 
507 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>