More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1561 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  100 
 
 
437 aa  884    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.68 
 
 
435 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  32.86 
 
 
435 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.44 
 
 
429 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.29 
 
 
448 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.9 
 
 
439 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  32.62 
 
 
429 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  32.62 
 
 
429 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  31.26 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.53 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.86 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.24 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  31.03 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.05 
 
 
446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.22 
 
 
430 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  31.9 
 
 
429 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  31.65 
 
 
437 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  30.94 
 
 
437 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  30.81 
 
 
448 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.63 
 
 
446 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  30.26 
 
 
440 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.66 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.1 
 
 
438 aa  189  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  29.69 
 
 
436 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.47 
 
 
435 aa  186  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  29.22 
 
 
436 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.83 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.54 
 
 
433 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  28.44 
 
 
436 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.62 
 
 
488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.84 
 
 
427 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  29.36 
 
 
436 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  28.2 
 
 
436 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.81 
 
 
435 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  29.45 
 
 
436 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.67 
 
 
436 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  29.05 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.75 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.44 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.44 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.27 
 
 
434 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  30.09 
 
 
491 aa  179  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  30.49 
 
 
437 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  29.02 
 
 
432 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  28.43 
 
 
432 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  31.46 
 
 
440 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  28.43 
 
 
432 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.02 
 
 
432 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  28.43 
 
 
432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  28.09 
 
 
443 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  28.43 
 
 
432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  28.43 
 
 
432 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.92 
 
 
437 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.77 
 
 
425 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  28.95 
 
 
435 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  27.96 
 
 
436 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  28.19 
 
 
432 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.53 
 
 
425 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  29.78 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  27.95 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.84 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.05 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.78 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  31.58 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.41 
 
 
434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  27.92 
 
 
434 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  27.92 
 
 
434 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  27.92 
 
 
434 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.87 
 
 
461 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.87 
 
 
478 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  27.64 
 
 
436 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  27.92 
 
 
434 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.48 
 
 
454 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.22 
 
 
431 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.75 
 
 
433 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  27.54 
 
 
441 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  31.01 
 
 
463 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.64 
 
 
432 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.07 
 
 
434 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  26.51 
 
 
435 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.32 
 
 
432 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.12 
 
 
426 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  26.81 
 
 
434 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.57 
 
 
434 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  29.64 
 
 
434 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>