More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09080 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  100 
 
 		 452 aa  894    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  58.28 
 
 		 471 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  56.96 
 
 		 460 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  57.14 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  54.34 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  54.59 
 
 		 464 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  55.53 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  55.61 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  52.11 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  53.54 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  52 
 
 		 519 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  46.92 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  44.28 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  46.33 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  43.31 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  46.58 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  46.1 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  44.52 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  44.22 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  47.42 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  43.96 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  46.71 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  44.52 
 
 		 463 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  42.73 
 
 		 473 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  43.33 
 
 		 448 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  42.74 
 
 		 463 aa  354  2e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  43.05 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  45.73 
 
 		 481 aa  352  8.999999999999999e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  42.14 
 
 		 449 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  41.91 
 
 		 491 aa  349  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  43.68 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  43.68 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  43.68 
 
 		 478 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  43.45 
 
 		 449 aa  346  6e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  42.07 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  41.78 
 
 		 465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  41.51 
 
 		 466 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  41.38 
 
 		 458 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.02 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.4 
 
 		 435 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.61 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.28 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.15 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.31 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.25 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  26.91 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  36.69 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  27.55 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  29.89 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  31.83 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.54 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.24 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.97 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.27 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.87 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  27.67 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.45 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.7 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.75 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.8 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  27.44 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.67 
 
 		 428 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.64 
 
 		 427 aa  162  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  34.1 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  34.1 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.6 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  29.6 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  27.63 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  32.11 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  27.54 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.91 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.07 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.91 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  25.92 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  27.51 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  31.53 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.15 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  31.33 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  33.67 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.23 
 
 		 450 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.5 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.39 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  32.31 
 
 		 437 aa  151  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  30.38 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.65 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.02 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.28 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  25.47 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  28.71 
 
 		 436 aa  150  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  32.46 
 
 		 449 aa  150  6e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  27.73 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.38 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>