More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0809 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  100 
 
 
428 aa  848    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  61.83 
 
 
428 aa  527  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  52.93 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  49.07 
 
 
428 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  51.4 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  48.36 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  49.65 
 
 
427 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  46.48 
 
 
426 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  46.96 
 
 
435 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  49.53 
 
 
425 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  50 
 
 
425 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  49.53 
 
 
425 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  47.78 
 
 
438 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  49.06 
 
 
425 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  49.3 
 
 
425 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  46.96 
 
 
446 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  49.59 
 
 
428 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  42.89 
 
 
435 aa  353  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  49.04 
 
 
428 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  43.33 
 
 
433 aa  346  5e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  43.06 
 
 
429 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  41.59 
 
 
435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  43.46 
 
 
433 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  43.46 
 
 
433 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  41.08 
 
 
446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  42.65 
 
 
436 aa  333  4e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  41.12 
 
 
449 aa  308  8e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  37.65 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  40.32 
 
 
427 aa  296  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.92 
 
 
438 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  40.95 
 
 
451 aa  292  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  38.77 
 
 
431 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  39.45 
 
 
427 aa  280  3e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  39.35 
 
 
427 aa  279  6e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  36.9 
 
 
439 aa  265  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  38.42 
 
 
430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.85 
 
 
488 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  36.74 
 
 
478 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  36.66 
 
 
439 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.91 
 
 
433 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  34.98 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  35.98 
 
 
424 aa  241  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  33.64 
 
 
435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.07 
 
 
431 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.9 
 
 
433 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  31.8 
 
 
435 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.98 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.6 
 
 
471 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  31.87 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  30.25 
 
 
430 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  31.41 
 
 
429 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  31.41 
 
 
429 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  33.76 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.04 
 
 
483 aa  200  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  29.46 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  28.53 
 
 
447 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.5 
 
 
437 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.93 
 
 
455 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.93 
 
 
455 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  31.14 
 
 
461 aa  196  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  28.54 
 
 
460 aa  194  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  33.08 
 
 
443 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  33.08 
 
 
443 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  28.5 
 
 
447 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.32 
 
 
435 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  28.21 
 
 
448 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  28.04 
 
 
507 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  30.25 
 
 
471 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  28.21 
 
 
463 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  26.16 
 
 
448 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  28.74 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  28.74 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  30.84 
 
 
500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.41 
 
 
433 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  28.04 
 
 
426 aa  182  1e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.11 
 
 
479 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.72 
 
 
434 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  31.47 
 
 
432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  29.77 
 
 
468 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.06 
 
 
434 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.06 
 
 
434 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29 
 
 
481 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  27.59 
 
 
474 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.29 
 
 
485 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  27.74 
 
 
481 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  26.91 
 
 
443 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  30.81 
 
 
434 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  31.06 
 
 
434 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  30.81 
 
 
434 aa  176  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.86 
 
 
434 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  27.04 
 
 
450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  26.76 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.81 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.81 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.81 
 
 
434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>