More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3652 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  97.1 
 
 
482 aa  876    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  100 
 
 
478 aa  942    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  76.41 
 
 
479 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  100 
 
 
478 aa  942    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  78.83 
 
 
473 aa  700    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  73.29 
 
 
466 aa  634  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  61.42 
 
 
454 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  58.02 
 
 
479 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  57.93 
 
 
461 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  58.33 
 
 
450 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  54.57 
 
 
513 aa  485  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  50 
 
 
481 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  46.6 
 
 
471 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  46.88 
 
 
448 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  47.86 
 
 
463 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  48.05 
 
 
491 aa  395  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  45.51 
 
 
468 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  47.33 
 
 
465 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  44.68 
 
 
460 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  44.64 
 
 
507 aa  388  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  47.39 
 
 
449 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  45.65 
 
 
464 aa  388  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  45.59 
 
 
483 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  45.23 
 
 
481 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.31 
 
 
469 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  44.51 
 
 
463 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  44.3 
 
 
454 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  42.89 
 
 
452 aa  363  3e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  44.8 
 
 
455 aa  357  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  45.07 
 
 
469 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  42.22 
 
 
466 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  44.05 
 
 
470 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  43.92 
 
 
458 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  42.98 
 
 
471 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  44.75 
 
 
519 aa  343  5.999999999999999e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  41.42 
 
 
449 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  40.27 
 
 
459 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  37.38 
 
 
449 aa  276  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.24 
 
 
435 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.36 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.78 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.61 
 
 
438 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  33.33 
 
 
446 aa  210  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.61 
 
 
435 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.03 
 
 
435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.9 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.77 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  30.77 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.33 
 
 
488 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.28 
 
 
425 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.04 
 
 
425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.04 
 
 
425 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.52 
 
 
427 aa  190  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.7 
 
 
428 aa  190  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.31 
 
 
433 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.31 
 
 
433 aa  189  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.07 
 
 
436 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.43 
 
 
446 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.02 
 
 
438 aa  187  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.42 
 
 
428 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.21 
 
 
432 aa  186  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.62 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.54 
 
 
433 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.75 
 
 
431 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.85 
 
 
435 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.97 
 
 
427 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.76 
 
 
435 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.33 
 
 
434 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.1 
 
 
427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.07 
 
 
433 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.5 
 
 
426 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.1 
 
 
427 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.6 
 
 
435 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  28.13 
 
 
428 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  28.13 
 
 
428 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.95 
 
 
428 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  30.88 
 
 
433 aa  167  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  32.29 
 
 
451 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.73 
 
 
436 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.54 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.72 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.11 
 
 
447 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  29.38 
 
 
447 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  30.47 
 
 
436 aa  160  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.44 
 
 
437 aa  160  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.52 
 
 
448 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  32.04 
 
 
407 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.29 
 
 
440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  30 
 
 
434 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  30 
 
 
434 aa  154  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  28.82 
 
 
433 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  30.06 
 
 
448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  28.93 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  28.47 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>