More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1733 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1239  trigger factor  88.91 
 
 
433 aa  783    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  100 
 
 
433 aa  858    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  100 
 
 
433 aa  858    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  59.29 
 
 
428 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  57.88 
 
 
427 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  59.76 
 
 
428 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  57.78 
 
 
425 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  57.55 
 
 
425 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  57.31 
 
 
425 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  57.31 
 
 
425 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  57.31 
 
 
425 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  57.31 
 
 
425 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  57.31 
 
 
425 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  56.6 
 
 
425 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  56.37 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  56.37 
 
 
425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  48.39 
 
 
435 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  47.91 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  47.02 
 
 
435 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  49.07 
 
 
446 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  45.77 
 
 
427 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  45.33 
 
 
449 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  45.67 
 
 
427 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  46.1 
 
 
429 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  44.96 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  43.79 
 
 
426 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  41.3 
 
 
439 aa  345  6e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  43.46 
 
 
428 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  41.18 
 
 
438 aa  339  7e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  44.07 
 
 
428 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  42.42 
 
 
428 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  39.91 
 
 
435 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  41.96 
 
 
432 aa  330  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  40.52 
 
 
446 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  42.55 
 
 
431 aa  325  1e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  42.66 
 
 
438 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.74 
 
 
438 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.9 
 
 
428 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  42.62 
 
 
428 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  36.93 
 
 
488 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  38.14 
 
 
451 aa  276  6e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.83 
 
 
435 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  34.93 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.87 
 
 
435 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.08 
 
 
433 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  35.64 
 
 
442 aa  237  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  35.82 
 
 
431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.73 
 
 
433 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  33.09 
 
 
433 aa  225  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  35.53 
 
 
424 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  34.19 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.74 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.63 
 
 
448 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  34.23 
 
 
435 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.85 
 
 
439 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.19 
 
 
434 aa  212  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  31.88 
 
 
447 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  33.01 
 
 
432 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  34.1 
 
 
435 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.06 
 
 
448 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  30.93 
 
 
472 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.08 
 
 
471 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  33.33 
 
 
443 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  31.81 
 
 
468 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  31.76 
 
 
447 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.19 
 
 
485 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  30.84 
 
 
481 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  30.08 
 
 
469 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  30.7 
 
 
472 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  32.04 
 
 
432 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  31.48 
 
 
432 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.07 
 
 
437 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  31.46 
 
 
432 aa  202  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.86 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.32 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  31.8 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.5 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.8 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  31.38 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  31.8 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  31.8 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  31.8 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.05 
 
 
479 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.33 
 
 
500 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  29.93 
 
 
500 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  32.41 
 
 
518 aa  199  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  34.86 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  30.75 
 
 
447 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  32.75 
 
 
479 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  30.83 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.09 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  31.04 
 
 
473 aa  195  1e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>