More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1431 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1431  trigger factor  100 
 
 		 432 aa  868    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  65.05 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  65.27 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  65.27 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  65.05 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  65.27 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  64.34 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  65.05 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  65.05 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  65.05 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  64.12 
 
 		 432 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  64.35 
 
 		 432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  63.64 
 
 		 434 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  64.12 
 
 		 432 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  63.19 
 
 		 432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  62.96 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  63.64 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  62.18 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  62.7 
 
 		 434 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  61.34 
 
 		 433 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  61.48 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  58.93 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  59.44 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  56.88 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  55.71 
 
 		 434 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  56.41 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  56.41 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  56.41 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  55.94 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  56.05 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  55.94 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  56.41 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  55.94 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  55.94 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  56.41 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  53.85 
 
 		 434 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  55.01 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  54.31 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  52.53 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  52.52 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  51.28 
 
 		 435 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  50.47 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  50.47 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  50.47 
 
 		 443 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  49.07 
 
 		 436 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  50.23 
 
 		 437 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  49.3 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  48.84 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  50 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  48.6 
 
 		 436 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  48.37 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  47.67 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  46.51 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  43.51 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  45.58 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  45.81 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  43.76 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  42.69 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  43.29 
 
 		 450 aa  364  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  44.58 
 
 		 445 aa  358  9e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  42.55 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  42.55 
 
 		 447 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  40.14 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  40.04 
 
 		 448 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  40.14 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  39.08 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  40.38 
 
 		 434 aa  332  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  39.31 
 
 		 443 aa  332  8e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  39.37 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  40.37 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  39.81 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  38.93 
 
 		 448 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  39.15 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  38.93 
 
 		 448 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  39.09 
 
 		 448 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  39.09 
 
 		 448 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  38.7 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  38.39 
 
 		 449 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0266  trigger factor  38.98 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  37.88 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  38.48 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  38.48 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  39.17 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  38.31 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  39.04 
 
 		 437 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  39.63 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  39.5 
 
 		 449 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  39.05 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>