More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1690 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  100 
 
 		 439 aa  870    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  47.45 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  45.24 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  43.78 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  42.36 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  42.36 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  37.91 
 
 		 437 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  39.15 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  35.45 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  38.14 
 
 		 428 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  41.02 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  36.92 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  36.28 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  35.75 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  37.44 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  35.21 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  37.19 
 
 		 425 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  37.33 
 
 		 446 aa  252  9.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  35.28 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.9 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  35.28 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  34.88 
 
 		 443 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  36.87 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  36.66 
 
 		 428 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  37.08 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.63 
 
 		 444 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  36.8 
 
 		 433 aa  237  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  40.26 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  35.25 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  34.64 
 
 		 435 aa  236  8e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  32.39 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.52 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  34.74 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.16 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  35.48 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  38.48 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  33.64 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  33.18 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  33.18 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  33.18 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  37.84 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  31.53 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  34.07 
 
 		 436 aa  226  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  33.41 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  34.11 
 
 		 432 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  31.69 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  33.11 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.12 
 
 		 445 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  32.13 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  32.33 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  31.69 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  33.41 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  33.41 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  32.88 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  30.88 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  33.41 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  33.41 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  33.41 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  32.17 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.47 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  37.46 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  31.46 
 
 		 437 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.96 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  31.22 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.19 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.63 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  33.18 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  32.71 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  37.46 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.05 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.4 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.47 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  30.05 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  33.85 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  33.85 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  32.71 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  33.49 
 
 		 435 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  31.7 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.44 
 
 		 447 aa  214  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.48 
 
 		 448 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  33.18 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.4 
 
 		 512 aa  212  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.09 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  31.94 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>