More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1094 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00387  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  85.12 
 
 		 432 aa  752    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  84.65 
 
 		 432 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  84.33 
 
 		 434 aa  748    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  86.18 
 
 		 434 aa  768    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  85.12 
 
 		 432 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  86.05 
 
 		 432 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  86.05 
 
 		 432 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  85.48 
 
 		 434 aa  748    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  88.94 
 
 		 434 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  85.81 
 
 		 432 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  86.05 
 
 		 432 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  88.94 
 
 		 434 aa  791    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  85.81 
 
 		 432 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  80.88 
 
 		 434 aa  706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  100 
 
 		 434 aa  870    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  88.94 
 
 		 434 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  85.35 
 
 		 432 aa  753    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  70.4 
 
 		 433 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  69.12 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  68.2 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  64.34 
 
 		 432 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  66.51 
 
 		 432 aa  581  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  63.49 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  63.57 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  63.26 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  63.26 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  63.26 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  63.26 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  62.09 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  62.82 
 
 		 434 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  62.33 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  62.33 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  60.47 
 
 		 434 aa  544  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  61.63 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  62.09 
 
 		 434 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  61.86 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  60.97 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  61.16 
 
 		 434 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  58.76 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  57.54 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  53.01 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  53.01 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  50.93 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  51.17 
 
 		 443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  50.23 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  51.17 
 
 		 436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  51.17 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  51.42 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  50.94 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  50.94 
 
 		 436 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  51.17 
 
 		 436 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  50.7 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  49.77 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  48.04 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  50.84 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  46.77 
 
 		 435 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  47.53 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  45.45 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  45.68 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0266  trigger factor  42.66 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  42.96 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  42.49 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  42.53 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  42.3 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  42.99 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  43.22 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  43.22 
 
 		 432 aa  348  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  40.78 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  40.09 
 
 		 436 aa  345  7e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  40.18 
 
 		 443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  39.72 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  40.22 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  41.28 
 
 		 436 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  40.58 
 
 		 449 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  40.96 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  39.55 
 
 		 448 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  39.33 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  39.33 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  40.37 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  40.83 
 
 		 436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  39.33 
 
 		 448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  39.55 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  39.1 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  39.1 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  37.35 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  39.33 
 
 		 448 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  39.27 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  40.6 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>