More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1719 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  100 
 
 		 434 aa  881    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  58.56 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  52.89 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  52.89 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  52.89 
 
 		 448 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  52.42 
 
 		 448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  51.73 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  52.76 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  52.66 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  51.96 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  52.19 
 
 		 448 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  52.42 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  52.42 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  50.23 
 
 		 435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  51.01 
 
 		 451 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  51.38 
 
 		 449 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  51.02 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  51.48 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  51.48 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  51.13 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  49.88 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  49.43 
 
 		 436 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  49.43 
 
 		 436 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  48.74 
 
 		 436 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  49.43 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  49.43 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  47.02 
 
 		 437 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  47.36 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  47.82 
 
 		 436 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  49.19 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  48.62 
 
 		 435 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1408  trigger factor  45.5 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0266398  normal  0.89684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0933  trigger factor  47.56 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.748649  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0909  trigger factor  46.4 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  44.16 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  44.86 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  44.63 
 
 		 443 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  44.39 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  44.63 
 
 		 437 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  43.93 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  43.69 
 
 		 436 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  43.46 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  43.46 
 
 		 436 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  43.22 
 
 		 436 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  43.69 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  42.73 
 
 		 432 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  42.96 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  42.49 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  41.8 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  41.67 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  41.67 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  41.67 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  39.54 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  40.78 
 
 		 434 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  40.51 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  41.34 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  41.9 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  41.44 
 
 		 434 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  41.74 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  42.03 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  41.47 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  39.72 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  39.95 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  41.11 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  39.95 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  39.95 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  39.95 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  40.38 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  37.84 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  37.84 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  38.86 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  39.26 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  38.94 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  39.49 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  39.49 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  39.49 
 
 		 434 aa  328  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  40.23 
 
 		 433 aa  329  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  39.95 
 
 		 434 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  39.49 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  40.05 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  39.49 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  38.94 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  39.26 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>