More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0933 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0909  trigger factor  87.19 
 
 		 445 aa  806    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0933  trigger factor  100 
 
 		 445 aa  904    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.748649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  62.3 
 
 		 451 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  61.4 
 
 		 449 aa  564  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  61.28 
 
 		 447 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  61.05 
 
 		 447 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  63.21 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  58.6 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  58.37 
 
 		 448 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  58.6 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  58.6 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  58.37 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  58.82 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  58.6 
 
 		 448 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  56.56 
 
 		 448 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  56.56 
 
 		 448 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  56.11 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  58.69 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  58.47 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  58.47 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  58.47 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  58.69 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  58.47 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  58.47 
 
 		 449 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  58.01 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  47.53 
 
 		 436 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  47.87 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  48.07 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  46.94 
 
 		 437 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  46.26 
 
 		 436 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  46.97 
 
 		 436 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  46.94 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  46.94 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  46.94 
 
 		 436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  47.39 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  47.56 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  44.5 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  41.76 
 
 		 435 aa  355  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  41.5 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  42.27 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  37.47 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  37.47 
 
 		 436 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  35.73 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  37.25 
 
 		 437 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  37.1 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  38.55 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  37.25 
 
 		 437 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  37.02 
 
 		 437 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  36.34 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  37.02 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  36.57 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  37.19 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  36.66 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  37.14 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  36.73 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  36.57 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  36.73 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  36.57 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  36.79 
 
 		 436 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  36.43 
 
 		 434 aa  289  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  36.2 
 
 		 434 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  35.97 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  35.75 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  35.75 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  35.75 
 
 		 434 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  35.75 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  35.52 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  35.07 
 
 		 434 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  35.52 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  37.25 
 
 		 435 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  35.97 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  37.25 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  37.1 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  36.2 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  34.68 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  35.83 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  35.07 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  36.65 
 
 		 432 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  35.51 
 
 		 441 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  35.07 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  36.43 
 
 		 432 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1408  trigger factor  35.07 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0266398  normal  0.89684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>