More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl405 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  100 
 
 
426 aa  850    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  54.1 
 
 
428 aa  473  1e-132  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.94 
 
 
428 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.29 
 
 
427 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.74 
 
 
433 aa  224  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.74 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.74 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.49 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.45 
 
 
429 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  35.54 
 
 
427 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.57 
 
 
425 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  33.49 
 
 
427 aa  207  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.65 
 
 
425 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.65 
 
 
425 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.18 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.25 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.92 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.7 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  31.3 
 
 
473 aa  195  2e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  32.05 
 
 
449 aa  195  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  31.78 
 
 
435 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.1 
 
 
435 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.59 
 
 
428 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.81 
 
 
436 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.83 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.76 
 
 
426 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  33.52 
 
 
428 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  33.24 
 
 
428 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.63 
 
 
438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.89 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.04 
 
 
428 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  29.81 
 
 
446 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  31.84 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.05 
 
 
439 aa  172  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  28.16 
 
 
488 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  27.55 
 
 
472 aa  170  4e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  29.71 
 
 
431 aa  168  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.31 
 
 
438 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.92 
 
 
435 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.14 
 
 
438 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.46 
 
 
433 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.19 
 
 
439 aa  157  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.95 
 
 
435 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.26 
 
 
447 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.86 
 
 
448 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.12 
 
 
434 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  28.91 
 
 
424 aa  149  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  28.42 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30 
 
 
433 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.23 
 
 
442 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  28.05 
 
 
447 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  29.34 
 
 
444 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  33.14 
 
 
435 aa  145  2e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  28.5 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  27.74 
 
 
460 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.57 
 
 
441 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  28.33 
 
 
512 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  33.33 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  27.78 
 
 
436 aa  133  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.82 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  28.89 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  26.65 
 
 
469 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  27.72 
 
 
434 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  30.75 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  34.04 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.61 
 
 
500 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  27.64 
 
 
432 aa  130  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  28.9 
 
 
485 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  27.46 
 
 
463 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  26.38 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.27 
 
 
440 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  30.73 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  26.37 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  26.6 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.17 
 
 
431 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.93 
 
 
437 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  26.29 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  26.54 
 
 
449 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  26.62 
 
 
436 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.7 
 
 
437 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  26.54 
 
 
437 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  25.24 
 
 
500 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  28.14 
 
 
432 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>