More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3356 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  100 
 
 
435 aa  869    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  53.49 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  47.18 
 
 
426 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  46.45 
 
 
446 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  44.14 
 
 
438 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  45.54 
 
 
429 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  44.83 
 
 
446 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  45.22 
 
 
428 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  45.22 
 
 
428 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  42.56 
 
 
435 aa  354  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  44.64 
 
 
428 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  41.59 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  42.15 
 
 
427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  41.34 
 
 
438 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  41.22 
 
 
425 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  41.22 
 
 
425 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  39.44 
 
 
433 aa  333  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  39.91 
 
 
433 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  39.91 
 
 
433 aa  332  9e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  44.13 
 
 
428 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  43.53 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  40.75 
 
 
425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  40.28 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  38.28 
 
 
432 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  37.91 
 
 
436 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  41.25 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  40.84 
 
 
438 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  39.77 
 
 
433 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  37.59 
 
 
427 aa  293  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  39.95 
 
 
427 aa  280  3e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  37.12 
 
 
427 aa  280  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  35.5 
 
 
449 aa  276  7e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  37.47 
 
 
439 aa  275  8e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  36.99 
 
 
451 aa  274  3e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  37.12 
 
 
478 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  38.83 
 
 
431 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.18 
 
 
488 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.39 
 
 
435 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  34.62 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  34.36 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  34.36 
 
 
478 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  33.03 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  33.33 
 
 
479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  33.79 
 
 
435 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.8 
 
 
431 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  30.57 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  35.14 
 
 
430 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  32.12 
 
 
433 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.25 
 
 
433 aa  229  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  31.55 
 
 
461 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  32.57 
 
 
500 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.57 
 
 
454 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  30.8 
 
 
450 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.36 
 
 
471 aa  220  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  32.53 
 
 
500 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  33.1 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.09 
 
 
439 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  32.4 
 
 
463 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  31.52 
 
 
460 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  32.49 
 
 
428 aa  209  7e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.17 
 
 
442 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.65 
 
 
463 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  29.4 
 
 
452 aa  206  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  28.84 
 
 
513 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  32.51 
 
 
485 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  30.85 
 
 
447 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.57 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.14 
 
 
466 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  33.08 
 
 
432 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  32.17 
 
 
518 aa  199  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  30.5 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.27 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.43 
 
 
424 aa  197  3e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.91 
 
 
434 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  29.2 
 
 
466 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  28.24 
 
 
481 aa  196  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  28.34 
 
 
491 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.78 
 
 
426 aa  194  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  29.71 
 
 
465 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  28.8 
 
 
460 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  28.31 
 
 
507 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.36 
 
 
435 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  28.64 
 
 
471 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  29.33 
 
 
479 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  29.43 
 
 
449 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.44 
 
 
435 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.03 
 
 
512 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  30.51 
 
 
448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  33.15 
 
 
463 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.35 
 
 
452 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  28.21 
 
 
471 aa  189  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.1 
 
 
479 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.28 
 
 
455 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.77 
 
 
448 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>