More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1657 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  100 
 
 		 438 aa  871    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  44.73 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  47.53 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  45.88 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  46.59 
 
 		 425 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  46.12 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  46.12 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  45.48 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  46.35 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  46.03 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  45.67 
 
 		 428 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  42.35 
 
 		 433 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  41.34 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  41.18 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  41.18 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  41.31 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  40.65 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  41.41 
 
 		 432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  40.8 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  40.09 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  39.34 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  42.39 
 
 		 438 aa  316  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  40.71 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  39.11 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  37.65 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  36.62 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  38.37 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  43.09 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.54 
 
 		 428 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  36.28 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  37.56 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  36.28 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  35.66 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  36.03 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  35.93 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  33.65 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  35.51 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.71 
 
 		 435 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.78 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  34.68 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  34.82 
 
 		 451 aa  246  8e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.48 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.33 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  37.08 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  33.16 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.25 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  37.14 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.16 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  34.26 
 
 		 433 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  31.71 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  30.9 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  31.42 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.39 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  30.36 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  30.1 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  30.1 
 
 		 478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  32.05 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  30.36 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  32.71 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  34.47 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.41 
 
 		 454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  32.64 
 
 		 447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.18 
 
 		 448 aa  213  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.75 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  33.85 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  33.42 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  29.34 
 
 		 473 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  32.14 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.28 
 
 		 471 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  28.6 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.79 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  32.83 
 
 		 448 aa  205  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  29.33 
 
 		 479 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  27.34 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  32.34 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  27.23 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  28.61 
 
 		 452 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  27.42 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  27.65 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  31.18 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.47 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.35 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  33.87 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.25 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  36.56 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.28 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.89 
 
 		 460 aa  192  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  27.15 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.07 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.8 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.73 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  29.63 
 
 		 455 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.63 
 
 		 455 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  29.4 
 
 		 473 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  30.28 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>