More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1914 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  869    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  61.06 
 
 		 435 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  61.52 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  57.51 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  58.31 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  42.13 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  45.24 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  41.94 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  38.82 
 
 		 429 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  37.12 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  37.3 
 
 		 446 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  32.79 
 
 		 429 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  32.79 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  36.89 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  35.93 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  32.09 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.71 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  33.8 
 
 		 443 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.27 
 
 		 512 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  33.57 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.02 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.65 
 
 		 427 aa  243  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.3 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  38.02 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.11 
 
 		 448 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  34.8 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.4 
 
 		 488 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.61 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  35.25 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  40.98 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.73 
 
 		 442 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  33.8 
 
 		 446 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  40.37 
 
 		 428 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  33.25 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  33.03 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.29 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  34.11 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.02 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  34.11 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  29.56 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  33.73 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  33.73 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  31.9 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  31.25 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.64 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.94 
 
 		 445 aa  225  9e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  28.64 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.34 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  32.71 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  34.8 
 
 		 427 aa  222  9e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  34.84 
 
 		 449 aa  222  9e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  32.41 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.37 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.99 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  31.82 
 
 		 476 aa  219  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.44 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.03 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  31.99 
 
 		 460 aa  217  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  32.64 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  32.64 
 
 		 443 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.7 
 
 		 441 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.74 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.32 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.7 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  30.89 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.24 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.7 
 
 		 428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  29.3 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  30.75 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.02 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.02 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.02 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.87 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.54 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.25 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.44 
 
 		 434 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.86 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.24 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  35.4 
 
 		 431 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.86 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.86 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.31 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.31 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  30.02 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.86 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  30.91 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.58 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.63 
 
 		 447 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  30.84 
 
 		 434 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.18 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.02 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  31.02 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.02 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>