More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1152 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  100 
 
 		 450 aa  883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  71.71 
 
 		 479 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  59.19 
 
 		 513 aa  532  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  57.76 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  58.33 
 
 		 482 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  58.33 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  58.33 
 
 		 478 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  55.14 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  56.85 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  54.01 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  52.62 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  51.03 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  51.12 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  51.03 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  52.06 
 
 		 481 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  50 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  51.04 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  48.52 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  49.31 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  48.54 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  47.8 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  47.25 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  49.53 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  46.15 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  46.5 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  44.52 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  47.5 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  46.12 
 
 		 470 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  45.8 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  46.56 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  43.57 
 
 		 449 aa  360  2e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  45.79 
 
 		 454 aa  359  5e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  45.02 
 
 		 469 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  43.54 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  45.02 
 
 		 455 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  43.96 
 
 		 519 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  38.24 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  37.25 
 
 		 449 aa  277  2e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  34.66 
 
 		 488 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.48 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  30.8 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.51 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.88 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.63 
 
 		 438 aa  203  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.65 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.16 
 
 		 446 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.34 
 
 		 426 aa  193  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  35.65 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.48 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  31.65 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.86 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.63 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.1 
 
 		 432 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.71 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.91 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.75 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.54 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.48 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.46 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.04 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.05 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.25 
 
 		 438 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.04 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.91 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.91 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.34 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.94 
 
 		 433 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.23 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  33.08 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.48 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.99 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.18 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.13 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.22 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  30.09 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.62 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.42 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.35 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.97 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.97 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.97 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.97 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.23 
 
 		 435 aa  163  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  29.03 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.75 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.52 
 
 		 436 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  29.91 
 
 		 429 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.44 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.83 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  28.31 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  28.15 
 
 		 435 aa  156  9e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.74 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>