More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1894 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  100 
 
 		 432 aa  884    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  35.66 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  35.54 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  33.02 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.94 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.49 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.56 
 
 		 446 aa  213  7e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.06 
 
 		 446 aa  213  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  33.08 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.14 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.45 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.54 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.13 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  28.88 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.05 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.05 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  28.87 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.58 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.81 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.58 
 
 		 425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.76 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.34 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  30.79 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.82 
 
 		 436 aa  186  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.67 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.21 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.37 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  27.91 
 
 		 427 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.33 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  32.04 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  26.11 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  25.64 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  25.64 
 
 		 433 aa  169  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.6 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.6 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.14 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  28.1 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  28.14 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.45 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  28.9 
 
 		 478 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.23 
 
 		 430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  27.4 
 
 		 483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.83 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.35 
 
 		 436 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  26.46 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  26.19 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  26.14 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.15 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25.85 
 
 		 435 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  30.61 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  29.31 
 
 		 447 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  26.3 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  26.91 
 
 		 449 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1671  trigger factor  28.7 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  27.18 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.05 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  28.7 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.31 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  26.62 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  25.45 
 
 		 461 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  25.72 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.33 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  25.75 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  27.09 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.04 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.02 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.05 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  28.46 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.02 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  26.75 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  25.28 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  29.97 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  27.58 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  29.68 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  26.37 
 
 		 481 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.69 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  30.72 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  25.93 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  26.51 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.08 
 
 		 433 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  23.74 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  25.43 
 
 		 435 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  28.48 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  27.88 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  29.39 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1087  trigger factor  26 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.283245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  32.39 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  29.94 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  25.06 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.49 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  27.03 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  29.11 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.33 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.33 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>