More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2692 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  100 
 
 		 443 aa  902    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.72 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.42 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  34.42 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.8 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.1 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  34.88 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  30.86 
 
 		 437 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  30.7 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  32.16 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.62 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  29.23 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  28.54 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.3 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  28.54 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  28.25 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  29.74 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  28.9 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.32 
 
 		 436 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  28.9 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.44 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.23 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  28.57 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  28.34 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  25.64 
 
 		 435 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.4 
 
 		 437 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  28.34 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.4 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  31.79 
 
 		 435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  28.34 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  28.57 
 
 		 436 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  28.34 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  28.1 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.03 
 
 		 435 aa  189  9e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  27.87 
 
 		 437 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  28.18 
 
 		 512 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  29.85 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  28.1 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  28.04 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.64 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.04 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.61 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.84 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  28.9 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  27.88 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  27.49 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.14 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.95 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.95 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  27.61 
 
 		 432 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.23 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  28.24 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  27.63 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  28.04 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.48 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  27.7 
 
 		 452 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  28.71 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  28.04 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  28.04 
 
 		 478 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  27.97 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  28.07 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  25.99 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.79 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.71 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  27.88 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  27.78 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  27.78 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  27.55 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  28.87 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.91 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  27.8 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  26.21 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  27.08 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.94 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.81 
 
 		 483 aa  177  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.24 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.51 
 
 		 488 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.44 
 
 		 432 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.67 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  27.62 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  27.42 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  29.63 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  28.31 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  27.38 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  26.03 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1408  trigger factor  27.48 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0266398  normal  0.89684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.39 
 
 		 436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.76 
 
 		 435 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.97 
 
 		 432 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  26.1 
 
 		 436 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  27.25 
 
 		 432 aa  172  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  27.38 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  27.65 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>