More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1671 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1671  trigger factor  100 
 
 		 451 aa  892    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.09 
 
 		 428 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  29.95 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.69 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.72 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.23 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.64 
 
 		 427 aa  167  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  27.31 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.24 
 
 		 435 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.44 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.02 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.63 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  26.14 
 
 		 434 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.8 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.07 
 
 		 439 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.15 
 
 		 425 aa  159  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.97 
 
 		 429 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.38 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  28.09 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.36 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.86 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.07 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.07 
 
 		 425 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  35.92 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  25.68 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  31.13 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  27.43 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  35.28 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  27.42 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  27.42 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  27.42 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.14 
 
 		 479 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.32 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.67 
 
 		 446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  25.29 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  27.68 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.7 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.37 
 
 		 428 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  27.87 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  24.83 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  24.83 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  27.46 
 
 		 432 aa  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  24.6 
 
 		 434 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  27.42 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  27.42 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  29.55 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  27.42 
 
 		 432 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  27.42 
 
 		 432 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  27.42 
 
 		 432 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  28.5 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  28.26 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.17 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  25.83 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  26.01 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  24.37 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  27.89 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  27.89 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  27.39 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  27.79 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  24.43 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.82 
 
 		 471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  25.78 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  26.07 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  24.15 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  26.22 
 
 		 433 aa  146  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.43 
 
 		 435 aa  146  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  26.32 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  26.35 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  24.15 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  24.15 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  24.15 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.35 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  23.69 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  26.91 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  25.11 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  24.55 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  27.48 
 
 		 474 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  26.49 
 
 		 443 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  25.91 
 
 		 436 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  26.83 
 
 		 440 aa  144  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.82 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.23 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  24.63 
 
 		 449 aa  143  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  28.64 
 
 		 472 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  28.16 
 
 		 436 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>