More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2524 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  100 
 
 		 474 aa  940    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  47.15 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  45.18 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  45.53 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  43.9 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  45.29 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  43.94 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  40.92 
 
 		 447 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  41.78 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  41.78 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  42.36 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  36.32 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  36.53 
 
 		 472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  37.07 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  35.58 
 
 		 473 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  36.11 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  36.15 
 
 		 477 aa  306  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  35.46 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.92 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.22 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.06 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.24 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.07 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.22 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.08 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.22 
 
 		 425 aa  199  7e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.8 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.07 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.75 
 
 		 428 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.87 
 
 		 432 aa  196  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.18 
 
 		 435 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.48 
 
 		 446 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  31.14 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.99 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.99 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  30.73 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.42 
 
 		 434 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.24 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.52 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.86 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.92 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.8 
 
 		 438 aa  183  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  32.4 
 
 		 434 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  32.4 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  32.4 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.96 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.04 
 
 		 437 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.86 
 
 		 439 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.15 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  31.89 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  31.82 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  29.67 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  29.4 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.59 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.4 
 
 		 434 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.49 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.63 
 
 		 434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  30.87 
 
 		 434 aa  174  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  32.07 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  27.15 
 
 		 436 aa  172  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.93 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.88 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.83 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.48 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.15 
 
 		 440 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.79 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  28.71 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  29.12 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.72 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  32.25 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  31.02 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.29 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  164  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.68 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.17 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.6 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  27.4 
 
 		 442 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  30.71 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.56 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.9 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.12 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.32 
 
 		 426 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>