More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0198 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  100 
 
 		 435 aa  877    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  55.56 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  49.42 
 
 		 432 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  48.6 
 
 		 438 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  50 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  44.68 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  35.51 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.4 
 
 		 431 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.49 
 
 		 439 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.97 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  32.79 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.47 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  31.79 
 
 		 443 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.36 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.07 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.47 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.95 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.97 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.4 
 
 		 446 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.19 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.19 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  29.57 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.11 
 
 		 429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.42 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.74 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.74 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  28.5 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.07 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.27 
 
 		 425 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.91 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  28.31 
 
 		 442 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30 
 
 		 432 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.91 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  27.93 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  29.41 
 
 		 463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.16 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.74 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.44 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.57 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.14 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  30.08 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  28.47 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  27.38 
 
 		 481 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  27 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  26.8 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  26.33 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.88 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  28.37 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  27.82 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  28.67 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.54 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  28.13 
 
 		 431 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  27.94 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  27.94 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  27.94 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.11 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  26.21 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  26.21 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.27 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  26.23 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  28.53 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.21 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1671  trigger factor  26.6 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00079143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.07 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  28.44 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  26.57 
 
 		 471 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  27.15 
 
 		 437 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  26.77 
 
 		 479 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  27.25 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.19 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  26.8 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  26.7 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  26.51 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.03 
 
 		 437 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.68 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.81 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  29.33 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.2 
 
 		 436 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  27.83 
 
 		 518 aa  154  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  27.68 
 
 		 447 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  25.9 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.38 
 
 		 436 aa  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  27.01 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  24.88 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.17 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  26.09 
 
 		 444 aa  152  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  27.49 
 
 		 437 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  24.88 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.01 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  26.06 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  28.34 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  28.34 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  29.07 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  28.34 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>